تطور فيروس SARS-CoV-2 ليكتسب طفرات في البروتين الشوكي، وهو جزء الفيروس الذي يخرج من جسمه.
الائتمان: هين هارك جان وكريستين غانسالوس ، قسم علم الأحياء بجامعة نيويورك.
يقترح العلماء أن هذه الطفرات في بروتين سبايك هي السبب الرئيسي للانتشار السريع للفيروس في بعض أنحاء العالم.
في الأشهر الأخيرة ، جديدة وأكثرسلالات معدية من فيروس كورونا ، مما أدى إلى موجات جديدة من الوباء في دول مثل الهند والبرازيل. يتطلب الوضع المتدهور طرقًا للتنبؤ السريع بالسلالات الفيروسية المعدية الجديدة. لكن تتبع الخيارات الجديدة ليس بالمهمة السهلة ؛ يوضح تسلسل الجينوم أن بروتين ارتفاع SARS-CoV-2 وحده ، على سبيل المثال ، يحتوي على حوالي 5000 متغير محتمل.
فحص مثل هذه المجموعة الواسعة من الخياراتويشير العلماء إلى أنه يشكل تحديا كبيرا للطرق التجريبية التقليدية. ميزة المحاكاة الحاسوبية هي أنه يمكن بسهولة تقدير مائة طفرة في غضون أيام قليلة.
تحول العلماء إلى الطريقة الحسابيةالذي يصمم كيف يتعرف بروتين SARS-CoV-2 على مستقبل ACE2 - وهو بروتين موجود على سطح العديد من أنواع الخلايا - لدخول الخلايا المضيفة. وقاموا بتقييم 1003 مجموعة من الطفرات في بروتينات ارتفاع فيروس كورونا، بما في ذلك تلك التي أدت إلى ارتفاع كبير في حالات العدوى في البرازيل وجنوب أفريقيا والمملكة المتحدة والهند.
أظهر تقييم منهجي للخيارات ذلكتحدث الطفرات الشائكة التي ترتبط ارتباطًا وثيقًا بمستقبل ACE2 في مجموعتين ، أو "نقاط ساخنة" ، من الطفرات في واجهة الربط. تقع في مناطق مرنة هيكليًا. هذا يعني أن الطفرات التي تزيد الارتباط قد أعادت برمجة شكل العمود الفقري بشكل فعال لتعزيز قدرته على التعرف على مستقبلات ACE2.
نُشرت الدراسة في مجلة البيولوجيا الجزيئية.
اقرأ أيضا
تقوم طائرة بدون طيار Skyborg ذاتية القيادة التابعة لسلاح الجو الأمريكي برحلتها الأولى
تم العثور على فراشة ضخمة في أستراليا. جناحيها 25 سم
حوّل العلماء المنازل الخرسانية إلى بطاريات