Разработен е нов метод за откриване на алфа варианта на SARS-CoV-2 в отпадъчните води

Учени от интердисциплинарната изследователска група за антимикробна резистентност (AMR) в

Местоположение в Сингапур със служители от BiobotAnalytics, Nanyang Technological University (NTU) и MIT успешно разработиха иновативен метод за молекулярно търсене на B.1.1.7 (Alpha) вариант на SARS-CoV-2.  Той ще даде възможност за бързо и евтино наблюдение на други варианти на новия тип коронавирус в отпадъчните води.

Мониторингът на отпадъчните води помага бързо иненатрапчиво проследяване на разпространението на COVID-19. Допълнителната информация позволява на здравните власти да проследят пандемията на ниво общност. Съвсем наскоро фрагменти от вируса SARS-CoV-2 бяха открити в жилищни райони в Сингапур като част от проактивна програма за наблюдение на отпадъчните води. Тази информация, заедно с последващи тестове, позволи на Министерството на здравеопазването на страната да реагира бързо на ситуацията.

Откриването на варианти на коронавирус смониторингът на отпадъчните води е по -рядко срещан поради проблеми със съществуващите технологии. Следващото поколение последователност за мониторинг на отпадъчните води отнема време и е скъпо. Тестовете също нямат чувствителност. Международен екип от учени в ново проучване се опита да се справи с този проблем.

В проучване, публикувано всписание Environmental Science & Technology Letters, учените обясняват иновативен метод за молекулярно откриване, базиран на алел-специфичен RT-qPCR, който открива и количествено определя варианта B.1.1.7 (Alpha). Разработеният анализ, тестван и валидиран върху проби от отпадъчни води от 19 общности в САЩ, е в състояние надеждно да открие и количествено определи ниски нива на вариант B.1.1.7 (Алфа) с ниска кръстосана реактивност и пропорции на варианти до 1 процент в смесени Протектори на вируса на SARS -CoV-2.

Метод, насочен към мутации на протеинови шипове, които предсказват вариант В.1.1.7 (Алфа), може да бъде приложен с помощта на търговски достъпни протоколи RT-qPCR.

Прочетете още

Забавянето на въртенето на Земята предизвика отделянето на кислород на планетата

Астрономите забелязват необичайни структури в дълбокия космос

Вижте още 60 000-годишно неандерталско скално изкуство

AMR - Антимикробна резистентност

RT -qPCR - количествена PCR обратна транскрипция.