AI помага да се разпознаят остатъците от РНК на древни вируси в човешкия геном

Предишни проучвания показват, че когато вирусът навлезе в човешкото (и друго животинско) тяло, той

 може да промени ДНК на гостоприемника чрез добавяне на частсобствената си РНК. Известно е също, че древните вируси, заразили населението преди много години, понякога оставят остатъци от своята РНК в човешкия геном. Намирането им обаче се оказа трудна задача поради огромния брой сравнения, необходими за всеки „заподозрян“ вирус. В новата работа изследователите са използвали алгоритъм за машинно обучение, за да решат проблема.

За да обучат алгоритъма, учените са използвали РНК отизвестни неретровирусни ендогенни РНК вирусни елементи. Чрез обучение на алгоритъма на съвременната вирусна РНК, системата може да усети как изглежда като цяло. Изследователите смятат, че подобни прилики вероятно са съществували и в древна РНК. След обучение учените промениха системата, за да предотвратят възможно най-много фалшиви положителни резултати. След това го прокараха върху човешкия геном и намериха около 100 възможности за по-нататъшно разглеждане. След като ги изследваха, изследователите установиха, че много от тях вече са известни, а някои са под прага, който са задали като опция за преминаване / неуспех. Останал им е само един възможен остатък от неизвестен вирус.

По-късно учените провериха дали са открили същотоостатъчна вирусна РНК в геномите на други видове, като маймуни и шимпанзета. Това откритие предполага, че инфекцията и по-нататъшното изменение на ДНК са настъпили преди поне 43 милиона години.

Изследователите отбелязват, че повече информация за древните вируси и тяхното въздействие върху човешкия геном ще даде представа за нюансите на поведението на съвременните вируси, които все още са неизвестни.

Прочетете още

Аборт и наука: какво ще се случи с децата, които ще раждат

Радарите са намерили последния форт Tlingit в Аляска. Търсят го повече от 100 години

Една трета от оздравелите от COVID-19 се завръщат в болницата. Всеки осми - умира