Към днешна дата новият тип коронавирус е причинил 3,9 милиона смъртни случая по света. В началото на пандемията
Сега изследовател от Сиатъл откри изтрити файлове от Google Cloud, които разкриват 13 частични генетични последователности от някои от най-ранните случаи на COVID-19 в Ухан.
Последователностите не променят балансаот или от много теории за това как е възникнал SARS-CoV-2. Например, те не подкрепят теорията, че вирусът е изтекъл от строго охранявана лаборатория в Ухан. И все пак доказателства сочат, че новият коронавирус е циркулирал дори преди първото голямо огнище да бъде открито на пазар за морски дарове в провинциален Китай.
За да се определи точно как и къде се е случиловирус, учените трябва да намерят така наречения вирус-предшественик, от който произхождат всички останали щамове. Досега най-ранните последователности са взети най-вече от дела на пазара на морски дарове в Хуанан в Ухан. Първоначално се предполагаше, че SARS-CoV-2 се появи за първи път в края на декември 2019 г. Случаите от началото на декември до ноември същата година обаче нямаха пазарна връзка. Това показва, че вирусът произхожда от различно местоположение.
Случаите, открити на пазара, включват тримутации, които липсват във вирусни проби, открити седмици по-късно извън пазара. Вирусите без мутации по-точно съответстват на коронавирусите, открити при подкови прилепи. Учените са уверени, че новият коронавирус по някакъв начин произхожда от прилепи, така че е логично да се предположи, че и предшественикът не е имал тези мутации.
А сега Джеси Блум от Медицинския институтХауърд Хюз от Сиатъл открива, че изтритите данни за последователността (вероятно някои от най-ранните проби на вируса) също са лишени от тези мутации.
Преди около година 241 генетичнипоследователността от пациенти с коронавирус е изчезнала от Sequence Read Archive, онлайн база данни, поддържана от Националните здравни институти (NIH).
Блум забеляза липсващите последователности,когато попаднах на електронна таблица в проучване, публикувано през май 2020 г. в PeerJ. Те бяха част от проекта на университета в Ухан PRJNA612766 и се предполагаше, че са качени в архива. Ученият потърси в архивната база данни за последователности и получи съобщението „Елементите не бяха намерени“.
Разследването му разкри, че изтрититепоследователностите се събират от университетската болница в Ухан. В същото време препринтът на проучване, публикувано въз основа на тези последователности, предполага, че те са взети от проби от назални тампони от амбулаторни пациенти със съмнение за COVID-19 в началото на епидемията.
Блум не можа да намери никакво обяснение защо последователностите бяха премахнати и имейлите му до авторите на изследването не получиха отговор.
Ученият отбелязва, че „няма убедителна научнапричини за изтриване на данни." Въпросът е, че последователностите напълно съответстват на образците, описани в работата. В документа няма корекции. Освен това проучването подчертава, че пробите са получени доброволно от индивиди и секвенирането не показва доказателства за замърсяване с плазмид или замърсяване на пробите. „Изглежда вероятно последователностите да са премахнати, за да се прикрие съществуването им“, заключава Блум.
Статия с неговите открития е публикувана на уебсайта за предпечат на biorxiv.
Прочетете още
Най-голямата комета в историята се вижда в Слънчевата система: тя е почти планета
Новият метод незабавно превръща въглерода в графен или диаманти
Намерен евтин начин да се спасят центровете на мегаполисите от прегряване