Как се появяват щамовете
Вирусите се възпроизвеждат само вътре в жива клетка, използвайки нейните ресурси. За това те
В света няма общоприета номенклатураимената на щамовете и използваните имена са доста произволни. Като правило те се състоят от отделни букви и цифри, които се изписват след името на вида. Например, един от най-известните щамове на E. coli еЕ. coliК−12.
Вирусът се опитва да поправи грешки при репликация, но не винаги успешно. Ако мутацията дава на патогена някакво житейско предимство, тя може да се задържи.
Колонии от бактериален щамЙерсиниявърху повърхността на агар-агар
В момента е известно, че SARS-CoV-2натрупва мутации с приблизително същата скорост като причинителя на грипа. Мутациите в генома на нов тип коронавирус почти винаги възникват не поради случайни грешки по време на копиране, както при много други вируси, а в резултат на повреда или неправилно редактиране на вече готово копие на РНК на вируса.
Как се откриват нови щамове на COVID-19
Проби от лигавици се вземат от пациенти идекодира генома на патогена. Тази информация се зарежда в общи бази данни и се сравнява. Например базата данни GISAID съдържа повече от два милиона коронавирусни генома от цял свят. Има тракер, който визуализира коя опция е идентифицирана в коя държава.
До 16 януари Роспотребнадзор обяви, че е изготвил специален тест, който ще идентифицира британския щам. Той ще покаже резултата 1,5 часа след като човекът е направил цитонамазка.
Необходими са по-задълбочени и сложни изследванияда се каже какво напрежение има пациентът. Сега [използвайки PCR тестове] можете да разберете дали човек има активен вирус - дали има определен вариант на COVID-19 или не. Но това не означава, че изобщо е невъзможно да се определи конкретен щам, просто отнема повече време и пари.
Алексей Аграновски, професор в Московския държавен университет и доктор на биологичните науки
Ето защо, в Русия, разберете колко хорасе зарази с коронавирус с определена мутация, все още не е възможно, но може да се направи произволни тестове, за да разберете колко широко е разпространен определен щам X.
На уебсайта CoVariants, използвайки GISAID данни, можете да видите кои мутации отличават генома на даден вариант. По този начин, делта вариантът има четири значителни мутации в протеина на шипа и две делеции.
Най-опасните варианти на COVID-19
СЗО класифицира четири варианта като опасни: алфа, бета, гама и делта.
- алфа
Щамът беше открит за първи път през октомври 2020 г. по време на пандемията от COVID-19 в Обединеното кралство от проба, взета предишния месец.
Оттогава шансовете му да доминира се удвоихана всеки 6,5 дни (предполагаем интервал на генериране). Това корелира със значително увеличение на инфекциите с COVID-19 в Обединеното кралство.
Има някои доказателства, че този вариант има 30% до 70% повишена предаваемост, а предварителните проучвания предполагат повишена смъртност.
Въпреки това, както се случва повечемутации, може да се наложи ваксината да бъде модифицирана. SARS-CoV-2 не мутира толкова бързо, колкото грипните вируси, например, и новите ваксини, които са доказали ефективността си до края на 2020 г., са видове, които могат да бъдат модифицирани, ако е необходимо.
Към края на 2020 г. телаздравни експерти и експерти от Германия, Обединеното кралство и Америка вярват, че съществуващите ваксини ще бъдат също толкова ефективни срещу щама VOC-202012/01, както и срещу предишните щамове.
- Бета
Щамът е открит за първи път в Южна Африка, както беше съобщенобеше съобщено от Министерството на здравеопазването на Южна Африка на 18 декември 2020 г. Изследователи и длъжностни лица казаха, че разпространението на този щам е по-високо сред младите хора без никакви основни медицински състояния и в сравнение с други щамове е по-вероятно да причини сериозно заболяване в тези случаи.
Учените отбелязват, че този щам съдържа няколко мутации, които му позволяват да се прикрепи по-лесно към човешките клетки.
На 8 януари 2021 г. Guardian обявява, че ваксинатаPfizer и COVID-19 BioNTech са показали при тестове, включително 20 кръвни теста, че е в състояние да осигури защита срещу щама 501.V2. Необходими са допълнителни изследвания, за да се установи точната степен на защита.
На 24 февруари 2021 г. компанията Moderna обяви началото на клиничните изпитвания на нова версия на своята ваксина. Новата версия е специално проектирана да се справи с 501.V2.
- Гама
Щамът е открит за първи път в Токио на 6 януари 2021 годинагодини от Националния институт по инфекциозни болести (NIID). Новият щам е открит при четирима души, пристигнали в Токио от щата Амазонас на 2 януари 2021 година.
Новият щам се появи за първи път през юли и беше първиоткрит през октомври, но по време на публикуването (декември 2020 г.), въпреки че честотата му се е увеличила значително, разпространението му все още е било ограничено главно до столицата на щата Рио де Жанейро.
Новост беше мутацията на протеиновия пик K417T, който позволявавирусът се свързва по-плътно с човешките клетки, а в някои случаи дори избягва антитела. Освен това вирусът заразява младите хора и бременните жени по-силно от оригинала.
На 11 февруари 2021 г. ръководителят на бразилското министерство на здравеопазването Едуардо Пазуело обявява, че този щам е три пъти по-заразен от „оригиналния“ SARS-CoV-2.
- Делта
През октомври 2020 г. линия B.1.617.2 беше открита за първи път в Индия. През втората половина на април 2021 г. щамът на индийската делта навлиза в Русия.
На 14 юни 2021 г. беше открит в Индиямутирал вариант B.1.617.2, който е известен като AY.1 или вариант „делта плюс“. „Delta Plus” се отличава с наличието на мутация K417N в шиповия протеин, който може да намали активността на антителата при възстановени и ваксинирани хора.
Индийското министерство на здравеопазването посочи три отличителни черти"делта плюс": повишена заразност, повишена способност за свързване с рецепторите на белодробните клетки и потенциална резистентност към терапия с моноклонални антитела.
До началото на юли 2021 г. Световната организацияЗдравеопазването е регистрирало делта щама в 98 страни както с високи, така и с ниски нива на ваксиниране на населението и в много страни той става доминиращ.
Според руския консорциум заЧрез секвениране на геномите на SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI), делта щамът заема малко повече от половината (52%) в пробите, получени в Санкт Петербург през май 2021 г., а през юни 2021 г. - повече от 90%.
Също така „делта плюс“, идентифициран през юни миналата година в Непал, принадлежи към категорията на заплашващите. Той има пет мутации в шип протеина, които правят вируса много опасен.
Какви възможности гледат учените от COVID-19
В списъка на СЗО има още четири варианта на SARS-CoV-2, които представляват интерес, но засега няма причина да се считат за по-опасни: Eta, Iota, Kappa, Lambda.
- Ламбда
Така нареченият "ламбда щам" SARS-CoV-2 за първи пътразпределени за Перу в края на миналото лято. Инфекции с новия щам също са докладвани в Аржентина и Чили. Впоследствие се разпространява в Германия, Испания, САЩ, Великобритания и няколко други страни.
Геномът на "ламбда щама" съдържа набор от осемключови мутации, за които се смята, че увеличават заразността на вируса. Бразилски учени, водени от Присила Уинк от Федералния университет в Рио Гранде до Сул, за първи път регистрираха следи от „ламбда варианта“ на SARS-CoV-2 в Бразилия и откриха нов вариант на тази версия на вируса. Щам "ламбда", открит към 19 юли в 29 страни
- Йота
Щамът е идентифициран през март миналата година в Ню Йорк,той се разпространява с 35% по-бързо. За известно време, успешно конкурирайки се с алфа, учените предположиха, че в комбинация с мутацията E484K в протеина на шип, който помага да се избягат антитела, тази опция би била опасна. СЗО му е предоставил статут на заплаха. Но тези прогнози не се сбъднаха и сега той просто се наблюдава.
Ще помогнат ли ваксините срещу нови щамове?
Няма ясен отговор. Ефективността на ваксините може да се оцени по различни начини:
- Следете как се променя броят на новите случаиинфекции и хоспитализации. Например в Обединеното кралство почти 88% от възрастното население е получило една доза от ваксината, 67% - втората. В страната доминира делта вариантът. Според официалната статистика заболеваемостта се е увеличила с повече от една трета през последната седмица, а броят на хоспитализираните се е увеличил с 46,8%.
- Проведете експеримент в лабораторията. Учените създават псевдовирус с шипов протеин, добавят една мутация след друга към неговия геном, имитирайки изследвания вариант. След това се смесва с кръвния серум на напълно ваксинирани хора и се накапва върху човешка клетъчна линия, податлива на коронавируса. След няколко дни заразените клетки се преброяват.
Прочетете още:
Обяснено как Вселената се отразява близо до черни дупки
Масово отравяне и нови версии за смъртта на цивилизацията: как се промениха знанията ни за маите
ОАЕ тестват технология за изкуствени валежи при 50-градусова топлина