Какво представлява Южноафриканският щам на коронавируса?
Щам 501.V2, или "африкански щам" или "южноафрикански"
Характеристики на щама
- Активно се разпространява сред младите хора
Изследователи и служители казаха товаразпространението на този щам е по-високо сред младите хора без съпътстващи заболявания и в сравнение с други щамове е по-вероятно да причини сериозни заболявания в такива случаи.
- Причинява опасността от втора вълна в африканските страни
Министерството на здравеопазването на Южна Африкапосочи, че този щам може да бъде движещата сила зад втората вълна на пандемията COVID-19 в страната поради щама, който се разпространява по-бързо от другите по-ранни щамове на вируса.
- Голям брой мутации
Учените отбелязват, че този щам съдържаняколко мутации, които му позволяват да се прикрепи по-лесно към човешките клетки поради три мутации в рецепторния свързващ домен (RBD) в шиповия гликопротеин на вируса: N501Y (аминокиселината аспарагин (N) е заменена с аминокиселината тирозин (Y) при позиция 501), K417N и E484K.
Две от тези мутации (E484K и N501Y) са в рецептор-свързващия мотив (RBM) на рецептор-свързващия домен (RBD).
Мутацията N501Y също е открита в щама202012/01, широко разпространено във Великобритания. Две други мутации, открити в 501.V2, E484K и K417N, липсват в британския щам. В допълнение, 501.V2 липсва мутацията 69-70del, открита в друг щам.
Откриване
Новият щам е открит чрез секвениранепълен геном. Няколко геномни последователности от тази линия бяха подадени в базата данни за генетична последователност GISAID, например последователността EPI_ISL_678597.
Международно разпространение
На 23 декември Мат Хенкок обяви, че двама душикоито са пътували от Южна Африка до Обединеното кралство са били заразени с 501.V2. 28 декември. Този щам е открит при двама души в Швейцария и един във Финландия.
На 29 декември щамът е открит в пътник,от Южна Африка до Япония и от международен пътник в Куинсланд, Австралия. На 30 декември щамът е открит в Замбия. На 31 декември той беше открит и във Франция при пътник, който се връщаше от Южна Африка.
На 2 януари 2021 г. е първият случай на заразяване с товащамът е идентифициран в Южна Корея. Австрия съобщи за първия си случай на заразяване с този щам, както и четири случая на заразяване с британския щам на 4 януари. На 8 януари 2021 г. Ирландия съобщава за 3 случая на този щам, като всички те са свързани с пътувания от Южна Африка.
Нечувствителност към ваксини
На 4 януари 2021 г. вестник The Telegraph съобщи,че оксфордският имунолог сър Джон Бел вярва, че новият южноафрикански щам е „голяма въпросителна“, тъй като може да е резистентен на ваксини, като по този начин разбива надеждите и ги заменя със страх.
На същия ден професорът по ваксинология Шабир Мадхиказа пред CBS News, че не е сигурно, че новият щам 501.V2 ще може да "заобиколи" защитата на ваксината, но той вярва, че "може да е по-малко ефективен".
Допълнителни мутации в шиповия протеин в щам 501.V2 бяха идентифицирани от доцента по клетъчна микробиология на Университета в Рединг Саймън Кларк като фактор, който предизвиква безпокойство, тъй като те „могат да направят вируса по-малко податлив на имунния отговор, предизвикан от ваксината“.
Лорънс Йънг, вирусолог от Университета на Уоруик, също отбеляза, че множествените мутации на шипове в този щам "могат да доведат до някакво бягство от имунната защита".
Някои изследвания показват, че този щам е избегнал неутрализиращо мулти-клонално антитяло, насочено към протеина на SARS-CoV-2.
Угур Сахин, изпълнителен директор на BioNTech,каза, че са необходими допълнителни изследвания, за да се гарантира, че настоящата ваксина на компанията работи срещу щама 501.V2, но ако ваксината трябва да бъде коригирана, компанията може да направи това за около 6 седмици.
На 8 януари Guardian съобщи, че ваксината Pfizer иBioNTech от COVID-19 показа при тестове, включващи 20 кръвни теста, че е в състояние да осигури защита срещу щама 501.V2. Необходими са допълнителни изследвания, за да се установи точната степен на защита.
Moderna планира да тества нова версия на своята ваксина, специално модифицирана за защита срещу щама 501.V2, тъй като Novavax предприема подобни мерки.
Според клинично проучване на ваксината Ad26.COV2.S от Johnson & Джонсън, неговата ефективност в Южна Африка е с 15% по-ниска, отколкото в САЩ (съответно 57% и 72%); разликата вероятно се дължи на разпространението на щама 501.V2 в Южна Африка.
Друго проучване на ваксината (NVX-CoV2373 от Novavax) показа 60% ефективност (при HIV-отрицателни участници) в Южна Африка, в сравнение с 90% ефективност в Обединеното кралство.
Според Ройтерс ваксината Pfizer е само малко по-малко ефективна срещу 501.V2. AstraZeneca планира да адаптира своята ваксина към този щам, като се очаква новата ваксина да бъде готова до есента на 2021 г.
На 24 февруари 2021 г. Moderna обяви началото на клиничните изпитвания на нова версия на своята ваксина. Новата версия е създадена специално за борба с 501.V2.
Мутации на щама
Учените са открили осем мутации в шип протеина на щама "Южна Африка". Този протеин е отговорен за навлизането на вируса в клетката.
- N501Y
Една от тези мутации, N501Y, също присъства в"Британският" щам B.1.1.7 и е свързан с засилено свързване с човешкия рецептор ACE2, към който SARS-CoV-2 е прикрепен към клетъчната повърхност.
- E484K
Друга мутация, E484K, в свързването на рецепторадомейн на вируса (RBD), определя повишената резистентност от 501Y.V2 към неутрализиращи антитела, което може да повлияе отрицателно на ефективността на ваксините COVID-19, насочени към протеина на шип.
Мутация на шипове E484K е свързана със случайповторно заразяване със щам 501.V2 SARS-CoV-2 в Бразилия, което според изследователите е първото подобно повторно заразяване със щам, съдържащ тази мутация.
Къде е разпределен щамът сега?
Вирус 501.V2 предизвика втора вълна на епидемията в Южна Африка, която достигна своя връх в средата на януари. Открит е в Ботсвана, Замбия, Кения и Гамбия, както и в САЩ, Канада, Австралия, Китай, Израел и части от европейски държави.
Освен това щамът е открит на територията на Русия, засега в единични количества.
Прочетете още
Уран е получил статута на най-странната планета в Слънчевата система. Защо?
Физиците са създали аналог на черна дупка и са потвърдили теорията на Хокинг. Къде води?
Аборт и наука: какво ще се случи с децата, които ще раждат