Инструментът, разработен от екипа, се нарича CShaper.
Това е мощен изчислителен инструмент, който може да
Систематично сегментиране и анализиране на изображения на клетки на ниво конкретни представители.Това е много важно за изучаването на клетъчното делене, както и за функциите на клетките и гените.Работен текст
За да създадат компютърно устройство, биолозите проучиха как растат животнитеот една клетка, оплодена яйцеклетка или чрез безброй клетъчни деления.По-специално, те искаха да знаят определени функции на гените, като например кои гени участватв деленето на клетките при образуването на различни органи или което причиняваанормални клетъчни деления, които причиняват растеж на туморите.
За да направят това, изследователите първо получиха изображения на клетките - тяхното "родословно дърво".След това те "изключват" (изтриват) гена от ДНК последователността и сравняватДве родословни дървета за анализ на промените в клетките и извеждане на генните функции.След това експериментът се повтаря, но с различни гени.
Биолозите са използвали ембриони в изследванетоCaenorhabditis elegans е вид червей, който споделя много биологични характеристики с хората, така че може да се използва за изследване на туморния растеж при хората.
"Като се има предвид, че C. elegans има около 20 000 гена, това означава, че ще са необходими почти 20 000 експеримента, ако изберете един ген наведнъж.Затова е изключително важно да използваме автоматизираната система за анализ на изображения, която сме разработили." Разследвания.
Клетъчните изображения обикновено се получават с помощта насканиране с лазерен лъч. Съществуващите системи за анализ на изображения могат само успешно да открият клетъчното ядро, но изображението на клетъчната мембрана ще бъде с лошо качество, което затруднява възстановяването на клетъчната форма.
Освен това няма надежден алгоритъм за сегментиране на триизмерни изображения кадър по кадър (т.е. четириизмерни изображения) на клетъчното делене.Сегментирането на изображенията е важен процес в компютърното зрение, който включваРазделете визуалния вход на сегменти, за да опростите анализа на изображението.Но изследователите трябва да прекарат стотици часове в ръчно етикетиране на много изображения на клетки.
Новата разработка на CShaper може да открива клетъчни мембрани, да създава клетъчни форми в триизмерното пространство и по-важното, автоматично да сегментира клетъчни изображения на клетъчно ниво.
Прочетете още
Опасното затопляне на климата ще започне след 7 години
Аборт и наука: какво ще се случи с децата, които ще раждат
Вижте най-красивите снимки на Хъбъл. Какво е видял телескопът за 30 години?