В новата работа авторите създадоха невронна мрежа, която определя каква форма ще приеме определен протеин.
Формата на протеина сега се изчислява с помощтаускорител на частици, който дава триизмерни снимки на протеинови молекули, или с помощта на суперкомпютър, който изчислява тяхната структура в съответствие със законите на химията и квантовата физика.
Авторите създадоха алгоритъма evoformer, койтосе опитва да определи структурата на отделни сегменти от протеинови молекули, представяйки ги под формата на триизмерно дърво от графики - математическа абстракция, която се състои от набор от обекти, свързани по двойки един с друг. Evoformer ги свързва помежду си въз основа на вече известни примери и постепенно променя структурата на връзките и местоположението на възлите, приближавайки се до оптималното.
След това те комбинираха такива алгоритми и създадоха невронна мрежа AlphaFold2.
Миналата година вече представихме първата версиянашата система, AlphaFold, която успя да предскаже структурата на протеините с почти атомна точност като част от състезанието CASP13. Сега създадохме нова негова версия, която значително надминава всички конкуренти по скорост и точност. Освен това неговият изходен код е напълно отворен.
Демис Хасабис, главен изпълнителен директор на Deepmind
В резултат на това невронната мрежа реконструира триизмерната форма с атомна точност за около 10 минути, с грешка от 0,096 нанометра за всеки атом вътре в протеина.
Прочетете още:
Обяснено как Вселената се отразява близо до черни дупки
Масово отравяне и нови версии за смъртта на цивилизацията: как се промениха знанията ни за маите
Промените в орбитата на Земята допринесоха за появата на сложен живот на планетата