Екип, ръководен от учени от Падерборн, Германия, професор Томас Д. Кюне и професор Кристиан
Ученые преодолели экзафлопную задачу докато симулира пиковия протеин на SARS-CoV-2 в реално научно изчислително приложение. Те направиха пробив с помощта на суперкомпютъра Perlmutter в Националния научноизчислителен център за енергийни изследвания (NERSC) в САЩ.
В момента Perlmutter е петинай-бързият компютър в света. Основата беше нов метод за моделиране, който Plössl и Kühne разработиха през последните години и интегрирани в програмата за квантова химия с отворен код CP2K.
В света на високопроизводителните изчисленияБроят на аритметичните операции с плаваща запетая с двойна точност (64 бита), извършени за секунда, е еталонът за производителност на суперкомпютри.През 1984 г. за първи път беше достигната границата от един милиард изчислителни операции за секунда, цифра, която всеки смартфон днес е надминал.
Моделиране на шиповия протеин SARS-CoV-2 сИзползвайки 4400 GPU ускорителя, учените надминаха прага на екзафлопса и достигнаха 1,1 екзафлопса. За сравнение, една стъпка на симулация отнема 42 секунди за 83 милиона атома, което означава, че процесът извършва приблизително 47 × 10 на 18-та степен на операции с плаваща запетая. Без изисквания към паметта подобно изчисление би отнело около 13 часа с първата петафлопс система, суперкомпютърът Roadrunner през 2008 г., и около 1,5 години с първата терафлопс система, ASCI Red, използвана през 1997 г.
Прочетете още
Маймунската шарка се превръща в глобален вирус: защо се предава толкова бързо
Нещо странно се случва във Вселената: как да се обяснят несъответствията в константата на Хъбъл
Диагностика за минута: как ИТ променя здравеопазването