Авторите са разработили мини-антитела с помощта на софтуер, който предсказва как
Това е много невероятно нещо! То отваря много възможности.
Стивън Мейо, химик в Калтек
Антителата се свързват добре с протеини, напр.с различни микроби. Затова фармацевтичните компании ги използват като лекарства за борба с инфекции и рак. Но антителата са големи протеини, така че те са скъпи за производство и процесът често е нестабилен. Авторите на изследването са работили, за да преодолеят тези проблеми.
Процесът, чрез който антителата се свързват с целтаизглежда като скален катерач, който се опитва да се изкачи на отвесна скала, обяснява Дейвид Бейкър, изчислителен структурен биолог от Университета на Вашингтон (UW). Повърхността на такава скала обикновено е гладка и има малка опора за ръцете и краката. Антителата са големи, така че могат да правят много хватки едновременно и да се държат здраво.
Но мини-антителата имат по-малко възможности.Изследователите се опитаха да преодолеят този недостатък; те идентифицираха местата за улавяне на протеините и изградиха мини-антитела въз основа на това. Но това работи само за добре проучени протеини.
За да заобиколите този проблем, Бейкър и колегисе обърнаха към софтуера Rosetta, който те разработиха, за да предскажат протеинови структури въз основа на тяхната аминокиселинна последователност. За да създаде карта на потенциалните опорни точки, екипът възложи на програмата да изчисли колко точно определени аминокиселини ще се свържат с различни точки на повърхността на целевия протеин. Изследователите са използвали Rosetta, за да създадат десетки хиляди виртуални мини-антитела.
Този софтуер ще позволиизследователи да разработят диагностични сонди, които да помогнат за откриването на заболявания на ранен етап, добавя Таня Кортем, биоинженер в Калифорнийския университет в Сан Франциско.
Можем да проектираме протеини засвържете се с всяка цел. Това означава, че минипротеините могат не само да блокират протеини, причиняващи болести, но и да насочват лекарства към раковите тъкани или да доставят излъчващи светлина или радиоактивни диагностични молекули до всякакви клетки. Това ще помогне за проследяване на напредъка в лечението.
Longxin Cao, UW postdoc
Прочетете още:
„Петият елемент“ съществува: нов експеримент ще потвърди, че информацията е материална
"Джеймс Уеб" направи най-ясната снимка на звезда в историята
Квантовото зареждане ще позволи рекордно бързо зареждане на електрически превозни средства