Проектът използва подхода Perturb-seq, който ви позволява да проследите въздействието на включването или изключването
При работа с технологията Perturb-seqизследователите правят генетични промени в клетките, използвайки CRISPR-Cas9 и след това използват едноклетъчно секвениране на РНК, за да съберат информация за РНК, която се експресира в резултат на тази генетична промяна. Изследователите отбелязват, че РНК контролира всеки аспект на клетъчното поведение, така че този метод помага за дешифрирането на повечето от клетъчните ефекти от минимални генетични промени.
В ново проучване учените използвахаклетъчни линии на човешки рак на кръвта, както и неракови клетки, получени от ретината, за извършване на Perturb-seq върху повече от 2,5 милиона клетки. Въз основа на получените данни генетиците изградиха изчерпателна карта, свързваща генотипове с фенотипове.
Авторите смятат, че резултатите от проекта ще помогнатбъдещи изследвания. Например, самите създатели на интегрираната карта са използвали данните за изследване на клетъчните ефекти на гени с неизвестни функции, за изследване на реакцията на митохондриите към стреса и за скрининг на гени, които причиняват загуба или увеличаване на хромозомите, фенотип, който е бил трудно за изучаване в миналото.
„Мисля, че този набор от данни ще позволи всякакви видове анализи, за които дори не сме се замисляли, на хора, които идват от различни области на биологията“, казва Том Норман, съавтор на изследването.
Прочетете още
Японците изхвърлиха гигантска турбина в океана, за да получат безкрайна енергия от течението.
Има начин за подобряване на синтеза: това е източник на безкрайна енергия
Астрономи от Япония откриха неизвестна структура в галактиката