Учени от Московския държавен университет. Ломоносов идентифицира няколко нови механизма, които контролират четливостта
Двойната спирала на ДНК е като винт.Предполага се, че той може едновременно да се плъзга и превърта по повърхността на протеините на черупката си. Успяхме да покажем, че поради локални деформации на ДНК и хистонови протеини, този процес протича на етапи. Първо се върти една част от ДНК, а след това следващата - нещо като гъсенично-винтов механизъм.
Алексей Шайтан, един от авторите на работата, водещ изследовател в Московския държавен университет
Общата дължина на всички ДНК молекули от човешки хромозомие около 2 метра. Нашите клетки компресират ДНК нишките 10 хиляди пъти, за да се поберат в ядрото. Например, една клетка навива ДНК верига около специални молекулярни „макарчета“ от хистонови протеини. Благодарение на това геномът може да бъде опакован много компактно, но значителна част от ДНК веригата е скрита вътре в тези структури.
Как точно се извършват движенията на ДНК в нуклеозомата,доскоро оставаше неясно. За да се справят с това, учените симулираха молекулярната динамика на нуклеозомите на атомно ниво на суперкомпютъра Ломоносов-2 в рекордно дълго време за компютърни симулации - 15 микросекунди. Тоест суперкомпютърът е действал като вид изчислителен микроскоп, който е дал възможност да се изследват механизмите на движение на ДНК в генома.
Благодарение на това Шайтан и колегите му проследихакак веригата на ДНК се отделя от протеините, как се променя структурата й и какви фактори влияят върху движението на верига от нуклеотиди, както и повторното й свързване с протеинови спирали.
Изследването също така има важен принос за дешифрирането на механизмите на функциониране на генома.
Прочетете още
Създадена е първата точна карта на света. Какво не е наред с всички останали?
Изобретателност хеликоптер успешно излита на Марс
НАСА разказа как ще доставят проби от Марс на Земята