Инструментът за редактиране на геном TALEN превъзхожда CRISPR-Cas9 с 5 пъти

Синдром на крехка X, сърповидно-клетъчна анемия, бета таласемия и други заболявания са

резултат от генетични дефектихетерохроматин. След провеждане на проучването учените стигнаха до извода, че в толкова плътно опаковани части от генома инструментът за редактиране TALEN е по-ефективен от традиционния CRISPR/Cas9. Биолозите съобщават своите открития в списаниетоNature Communications.

Според Humin Zhao, професор по химия ипо биомолекулярно инженерство от Университета на Илинойс в Урбана-Шампейн, който ръководи новото проучване, откритието потвърждава, че е необходим по-широк набор от инструменти за редактиране на генома, за да се покрият всички части на генома.

„CRISPR е много мощен инструмент, който революционизира генното инженерство“, обяснява Джао. "Но той все още има някои ограничения."

Жао и колегите му са използвали флуоресцентниедномолекулна микроскопия за директно наблюдение как работят два инструмента за редактиране на генома в живите клетки на бозайници. Флуоресцентните маркери позволяват на изследователите да измерват колко време е необходимо на CRISPR и TALEN да се движат по ДНК, както и да откриват и изрязват целевите области.

„Ние установихме, че CRISPR работи по-добрев по-малко уязвими региони на генома, но TALEN може да има достъп до тези гени в хетерохроматичния регион по-добре от CRISPR, каза Джао. „Видяхме също, че TALEN може да има по-висока ефективност при редактиране от CRISPR.“ Може да отреже ДНК и след това да направи промени по-ефективно."

Общо TALEN беше пет пътипо-ефективен от CRISPR в множество експерименти. Във всеки случай резултатите ще доведат до подобрени подходи за насочване към различни части на генома, Zhao заключава: "Или можем да използваме TALEN за определени приложения, или можем да се опитаме да подобрим ефективността на CRISPR с хетерохроматин."

Прочетете още

Аборт и наука: какво ще се случи с децата, които ще раждат

Радарите са намерили последния форт Tlingit в Аляска. Търсят го повече от 100 години

Една трета от оздравелите от COVID-19 се завръщат в болницата. Всеки осми - умира

Университет на Илинойс в Urbana-Champaign, UIUC- най-големият от кампусите на Университета на Илинойс. Основана през 1867г. Намира се в обединените градове Urbana и Champaign в центъра на Илинойс, САЩ.

Хетерохроматин - области на хроматин, които са в кондензирано (компактно) състояние по време на клетъчния цикъл. Характеристика на хетерохроматичната ДНК е нейната изключително ниска транскрибируемост.

Активатор-подобни ефекторни нуклеазиЕфекторните нуклеази, подобни на активатор на транскрипция, TALENs, са рестрикционни ензими, които могат да бъдат конструирани да режат специфични ДНК последователности.

CRISPR - специални локуси на бактерии и археи,състоящ се от прави повтарящи се последователности, разделени от уникални последователности. Разделителите са взаимствани от чужди генетични елементи, които клетката е срещала.

Cas9 (CRISPR свързан протеин 9,CRISPR-асоцииран протеин) е водеща РНК-контролирана ендонуклеаза, свързана с адаптивната имунна система CRISPR (групирани редовно разпределени палиндромни повторения) в редица бактерии, по-специалноStreptococcus pyogenes.S. pyogenesизползва Cas9 за съхраняване, проверка и рязане на чужда ДНК, като бактериофаг или плазмидна ДНК.