Tým vedený vědkyní RNA Anne Marie Pyleovou sestavil dosud nejobsáhlejší mapu
SARS-CoV-2 se spoléhá na svou jedinečnostStruktury RNA infikují člověka a způsobují onemocnění COVID-19. Příspěvek těchto struktur k infekcím a chorobám je ale často podceňován i vědci, říká Pyle, výzkumný pracovník na Howard Hughes Medical Institute na Yale University.
Podle všeho, pokud se jen soustředímena proteinech kódovaných v genomu viru pochopíme, jak funguje SARS-CoV-2. Ale u těchto typů virů mohou struktury RNA v genomu ovlivnit jejich schopnost fungovat ve stejné míře jako kódované proteiny.
Anna Marie Pyle, výzkumnice z Lékařského institutu Howarda Hughese na Yaleově univerzitě
Vědci nyní mohou začít přijít na to, jak na totyto struktury pomáhají viru. Tyto informace by mohly nakonec vést k nové léčbě COVID-19. Například jakmile vědci identifikují struktury RNA, které plní klíčové úkoly, bude možné navrhnout způsoby, jak je narušit a zabránit infekci.
Genom SARS-CoV-2, čítající přibližně 30 000 písmenRNA neobvykle dlouhá pro virus RNA. Konverze jeho RNA do 3D formy dává SARS-CoV-2 další sadu nástrojů, pomocí kterých lze kompenzovat omezený počet genů. „Virus RNA nejvíce těží z toho, jak využívá svůj genom,“ říká Pyle.
Barevné elektronické skenovánímikrofotografie buňky (modrá) silně infikované částicemi viru SARS-CoV-2 (červená), izolované ze vzorku pacienta. Fotografie pořízená v NIAID Integrated Research Facility (IRF) ve Fort Detrick, Maryland.
Úvěr: NIAID
Podle Jeffrey Keeft, strukturálníBiolog RNA a virolog na University of Colorado, vědci potřebují cestovní mapu své genomické krajiny ke studiu jakéhokoli RNA viru, zejména SARS-CoV-2. "Dr. Pyle vytvořil jakýsi globální atlas, který je skvělým výchozím bodem pro další kolo cílenějšího experimentování," říká. "V mnoha ohledech tento výzkum škrábe povrch bohatosti struktury RNA, která pravděpodobně v tomto viru existuje." Mám podezření, že nás čeká mnoho překvapení. “
Mapování také představujepředběžný krok směrem k novým lékům, které mohou cílit na struktury RNA viru. Cesta však může být dlouhá. Od roku 2014, kdy jeho laboratoř objevila nodulární strukturu, kterou viry dengue a západonilské viry používají k obcházení buněčné obrany, se Kieft snaží najít způsob, jak ji zneškodnit. Varuje, že výzkumná komunita není plně odhodlána identifikovat léky, které narušují strukturu RNA. "Tato strategie nebyla studována a aplikována stejným způsobem jako u proteinů," říká. Když však jednáte s pandemickým virem, jako je SARS-CoV-2, „zkuste všechno“.
Přečtěte si také
Svatozář Andromedy se blíží k naší galaxii. Řekneme vám, proč je to důležité
Příznaky koronaviru u dětí. Na co byste měli dávat pozor?
Ukázalo se, že Mayská civilizace opustila jejich města