Co je to „britský“ kmen koronaviru?
Kmen 202012/01 je kmen viru SARS-CoV-2, který způsobuje COVID-19. Tento
V polovině prosince se napětí začalo rychle zvyšovatšíření. To koreluje s významným nárůstem míry infekcí COVID-19 ve Spojeném království; předpokládá se, že toto zvýšení je alespoň částečně způsobeno mutací N501Y v doméně spike glykoproteinu vázajícího receptor, který se váže na receptor ACE2 v lidských buňkách.
Kmen je také pozoruhodný velkým počtem mutací ve srovnání se známým trendem mutací SARS-CoV-2 z prosince 2020.
Kmen je znám pod několika jmény. Ve vládní komunikaci a v médiích se běžně označuje jako „britský kmen COVID-19“ a „britský kmen koronaviru“.
Tento kmen byl dříve nazýván „první kmenpod revizí v prosinci 2020 (VUI - 202012/01) od Public Health England, ale byl snížen na Strain of Concern od Meery Chand a kolegů ve zprávě zveřejněné Public Health England dne 21. prosince 2020.
Ve zprávě napsané jménem KonsorciaGenomics COVID-19 UK (COG-UK) Andrew Rambeau a jeho spoluautoři označili tento kmen jako linii B.1.1.7. CDC také nazývá tento kmen 20B / 501Y.V1.
Země s potvrzenými případy VOC-2020/12/01
Odkud přišel?
Zřejmě z Jižní Afriky.První zprávu o tomto kmeni zveřejnila skupina místních biologů vedená da Oliveirou 22. prosince 2020 - vzorky byly odebrány počátkem října. Vzhledem k tomu, že ne všechny země mají programy dozoru pro nové kmeny, první detekce v zemi samozřejmě neprokazuje, že varianta vznikla v přesném místě, kde byla nalezena.
Vlastnosti „britského“ kmene
- Genetika
Mutace ve viru SARS-CoV-2 probíhají docela dobřeČasto: Podle COVID-19 Genomics Consortium Velké Británie (COG-UK) bylo nalezeno více než 4 000 mutací v samotném špičkovém glykoproteinu v různých kmenech tohoto viru.
Kmen VOC-202012/01 je definován 23 mutacemi: 13 nesynonymních mutací, 4 delece a 6 synonymních mutací (tj. 17 mutací mění proteiny a 6 nikoli).
- Přenositelnost
Britský vědecký poradní orgán NERVTAG(Advisory Group on New and Emerging Respiratory Viruses) dospěla dne 18. prosince 2020 k závěru, že má střední důvěru, že VUI-202012/01 je výrazně přenosnější než jiné kmeny, přičemž údaje zatím nejsou dostatečné k tomu, aby bylo možné učinit definitivní závěry o základním mechanismu zvýšeného propustnost.
Data získaná společností NERVTAG to ukázalakmen má "výběrový koeficient" 0,70 (70 %), za předpokladu generačního intervalu 6,5 dne. Pozdější práce používaly jako měřítko relativní počet reprodukcí, který je ukazatelem koeficientu výběru.
Na základě mírně odlišných údajů byl stanoven relativní počet reprodukcí („multiplikativní výhoda“) na 1,74 (to znamená, že tento kmen je o 74 % přenosnější).
Tento kmen se stal dominantním v Londýně ana východě a jihovýchodě Anglie po dobu jednoho až dvou měsíců. Podobný rychlý růst byl pozorován v Irsku a zdá se, že tento kmen se brzy stane dominantním i tam.
USA by měly dělat totéžv březnu. Nárůst infekcí SARS-CoV-2 na začátku nového roku je považován za důsledek zvýšené přenositelnosti kmene, zatímco výskyt ostatních kmenů klesá. To vyžaduje přísnější limity, aby se zabránilo rychlému exponenciálnímu nárůstu infekcí. Řízení přenosu tohoto kmene zase vypadá stále slaběji.
První obrázek britského kmene viru
Jsou vakcíny proti tomu účinné?
V minulosti bylo vyvinuto několik vakcín COVID-19.
Nicméně, jak se stane vícemutace, může být nutné vakcínu upravit. SARS-CoV-2 nemutuje tak rychle jako například viry chřipky a nové vakcíny, které se ukázaly jako účinné do konce roku 2020, jsou typy, které lze v případě potřeby upravit.
Ke konci roku 2020 orgányodborníci na zdraví a odborníci z Německa, Velké Británie a Ameriky věří, že stávající vakcíny budou stejně účinné proti kmenu VOC-202012/01 jako proti předchozím kmenům.
Dne 18. prosince 2020 dospěl NERVTAG k závěru, že „v současné době nejsou k dispozici dostatečné údaje pro vyvození závěrů o necitlivosti tohoto kmene na vakcínové antigeny.“
Zatím veřejné zdravotnictvíSpojené království potvrdilo, že neexistují „žádné důkazy“ o tom, že nový kmen bude rezistentní vůči vakcíně Pfizer-BioNTech, která se v současné době používá ve britském očkovacím programu, takže očkovaní lidé jsou stále chráněni.
Co je zvláštního na „britském“ kmeni?
Obecně má „britský“ kmen 29 mutacíve srovnání s původním kmenem Wuhan. To naznačuje, že mutuje mnohem rychleji než druhá, u nichž virologové zaznamenali přibližně dvě mutace za měsíc.
Kromě toho se v proteinu nachází mnoho mutacítrny nového kmene usnadňují navázání viru na receptory hostitelských buněk. Vědci proto naznačují, že kmen B.1.1.7 bude nebezpečnější - bude mít vyšší virulenci a případně schopnost vyhnout se působení vyvinutých vakcín.
V nové studii se autoři rozhodli použítpočítačové simulace k předpovědi toho, jak různé mutace „britského“ kmene ovlivní rychlost šíření a závažnost infekce, jakož i replikaci a patogenezi samotného viru.
Abychom vysvětlili neobvykle vysokou frekvenci mutací vyskytujících se jak v proteinu S spike, tak v N-terminální doméně, vědci nabízejí tři vysvětlení:
- dlouhodobá infekce virem u pacienta s oslabeným imunitním systémem umožnila viru mutovat vysokou rychlostí;
- adaptivní mutace začaly u zvířecích hostitelů, byly přeneseny na člověka prostřednictvím zoonotického přenosu a pokračovaly v lidském hostiteli;
- selektivní výběr, ke kterému dochází ve struktuře viru pod tlakem protilátek.
Výsledky simulace to ukázalystabilita vodíkových vazeb v mutantní variantě je vyšší. Jeho hrotový protein také vytváří více vazeb s receptorem hostitelských buněk a tyto vazby přetrvávají delší dobu. Odhadovaná přenosová rychlost kmene B.1.1.7 je o 70% vyšší a počet reprodukcí je o 0,4 vyšší než u klasické varianty.
Nebezpečí podle autorů spočívá i vže podle testovacích standardů, reverzní transkripční polymerázové řetězové reakce nebo RT-PCR nemusí rozpoznat virovou RNA nového kmene. Mutací pozměněný kmen mu také může umožnit vyhnout se neutralizaci protilátkami a snížit účinnost vakcín.
Kde je distribuován?
Nyní - prakticky po celém světě.Podle největší databáze genomů GISAID byla většina odpovídajících vzorků nalezena ve Velké Británii, Dánsku, USA, Francii, Španělsku a Irsku, existují genomy dokonce z tak relativně prosperujících zemí, jako je Nový Zéland a Singapur. Distribuční mapy si můžete prohlédnout zde.
S přítomností kmene v Rusku není situace úplněPrůhledná. 10. ledna Anna Popova informovala o svém objevu v zemi. V největší otevřené mezinárodní databázi GISAID genomů varianty B.1.1.7. z Ruska č.
Přečtěte si více
Podívejte se na obraz Marsu o 8 bilionech pixelů
Vědci vyvinuli náhradu za teorii relativity. Co je podstatou „teorie všeho“?
Potrat a věda: co se stane s dětmi, které porodí