AI pomáhá rozpoznat zbytky RNA starých virů v lidském genomu

Předchozí studie ukázaly, že když se virus dostane do lidského (a jiného zvířecího) těla, ano

 může změnit hostitelovu DNA přidáním částisvou vlastní RNA. Je také známo, že starověké viry, které infikovaly populaci před mnoha lety, někdy zanechaly zbytky své RNA v lidském genomu. Jejich nalezení se však ukázalo jako obtížný úkol kvůli obrovskému množství srovnání požadovaných pro každý „podezřelý“ virus. V nové práci výzkumníci použili k vyřešení problému algoritmus strojového učení.

K trénování algoritmu vědci použili RNA zznámé neretrovirové endogenní virové prvky RNA. Výcvikem algoritmu moderní virové RNA mohl systém získat představu o tom, jak to vypadá jako celek. Vědci se domnívají, že tyto podobnosti pravděpodobně existovaly také ve starověké RNA. Po tréninku vědci vylepšili systém, aby zabránili co největšímu počtu falešných pozitiv. Poté jej provedli na lidském genomu a našli asi 100 možností pro další zvážení. Po jejich prozkoumání vědci zjistili, že mnoho z nich již bylo známo a některé byly pod prahovou hodnotou, kterou nastavili jako možnost vyhovění / neúspěchu. Zbývá jim jen jeden možný zbytek neznámého viru.

Později vědci zkontrolovali, zda našli to samézbytková virová RNA v genomech jiných druhů, jako jsou opice a šimpanzi. Tento objev naznačuje, že k infekci a další změně DNA došlo nejméně před 43 miliony let.

Vědci poznamenali, že více informací o starých virech a jejich dopadu na lidský genom poskytne vhled do nuancí chování moderních virů, které jsou dosud neznámé.

Přečtěte si více

Potrat a věda: co se stane s dětmi, které porodí

Radary našli poslední pevnost Tlingitů na Aljašce. Hledali ho více než 100 let

Třetina z těch, kteří se vzpamatovali z COVID-19, se vrací do nemocnice. Každý osmý - umírá