Vědci objevili otisky prstů záhadných virů, které se ukrývaly ve starověké skupině mikrobů.
Tento týden v časopise Nature Microbiologynajednou byly zveřejněny tři články věnované virům archaea skupiny Asgard. Vědci zkoumali genomy virů z genomických a metagenomických dat a studovali jejich vztah s nejznámějšími skupinami virů. Získaná data pomohla vědcům odhadnout, jaké přesně byly funkce virů, které infikovaly asgardské archaea.
Pozoruhodné je, že se jedná o první studiiarchaální asgardské viry; předtím se nic nevědělo. V budoucnu může tento směr výzkumu ukázat, zda a jak se viry podílely na vzniku eukaryotických buněk na Zemi.
Obecně platí, že archaea skupiny Asgard mají mnoho genůkteré kódují eukaryotické proteiny. Vědci je také považují za nejbližší příbuzné eukaryot. Až dosud však vědci nevěděli, zda se podobnosti mezi členy asgardské skupiny a eukaryoty rozšířily i na viry, které je infikují.
První skupina vědců analyzovalametagenomické sekvence. Byly získány z hlubokomořských hydrotermálních ložisek. Biologové shromáždili šest genomů virů, které infikují archaea skupiny Asgardů. Ukázalo se, že patří ke čtyřem virům, jmenovaly se Fenrir (Fenrir), Sköll (Skoll), Nidhogg (Nidhogg) a Ratatoskr (Ratatoskr). Všichni jsou tvorové ze skandinávské mytologie.
Na základě genomických dat, biologovénavrhl, že jsou schopné semi-autonomní replikace genomu, opravy, epigenetické modifikace a transkripční regulace. Kombinují také vlastnosti bakteriálních a archaálních virů.
Jiná skupina vědců získala kompletní genom archaeaze skupiny Asgard a znovu sestavil genom kmene LCB_4, který byl považován za základní skupinu kmene Odinarchaeota. Biologové objevili sekvence dvou virů, dostaly jména Huginn a Muninn (Hugin a Munin jsou ve skandinávské mytologii pár havranů, kteří létají po světě Midgard a hlásí bohu Odinovi, co se děje). Viry s nimi související byly nalezeny v genomech jiných prokaryot, včetně archaea skupiny Asgard.
Třetí práce je věnována metagenomickému sestavení 20nové archaální viry skupiny Asgard ze vzorků sedimentů. Kombinací fylogenetické analýzy s hledáním lokusů CRISPR v metagenomických datech vědci rozdělili nalezené viry do tří skupin na úrovni rodiny.
Nakonec byli vědci schopni zjistit funkce pouze některých virových genů. Funkce velké většiny genů jsou stále neznámé.
Asgard nebo Asgardarchaeota - předpokládá sesuperkmen sestávající ze skupiny archaea, která zahrnuje Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota a Heimdallarchaeota. Zdá se, že eukaryota vznikla v Asgardu, ve větvi obsahující Heimdallarchaeota. To znamená, že archaea ze skupiny Asgardů, jak se mnozí biologové domnívají, mají nejblíže k předkům všech organismů, které mají buněčná jádra. Mohly přispět ke vzniku složitého života
Výsledky výzkumu naleznete zde, zde a zde.
Přečtěte si více:
Podívejte se na nebeský „Titanic“, který poběží na jadernou energii
NASA přišla na to, jak hledat život na Marsu: experiment ukázal, kde by mohl být
Astronomové našli planety, které jsou odlišné od Země, ale vhodné pro život
</ p>