Nový software najde bakterie odolné vůči antibiotikům, které infikují lidi a zvířata

V nové studii tým odborníků zkoumal velkou komerční drůbeží farmu v Číně a shromáždil 154

vzorek od zvířat, jatečně upravených těl, pracovníků, jejich mazlíčkůfarmy a prostředí. Ze vzorků izolovali specifické bakterie Escherichia coli (E. coli). V lidském střevě mohou žít zcela neškodně, ale mohou být i patogenní. A pokud jejich genom nese geny pro odolnost vůči některým lékům, může to vést k rozvoji vážných onemocnění, včetně těžkých žaludečních křečí, průjmu a zvracení.

Výzkumníci použili výpočetní přístupkterý kombinuje strojové učení, sekvenování celého genomu, sítě pro sdílení genů a mobilní genetické prvky k charakterizaci různých typů patogenů nacházejících se na farmě. Zjistili, že antimikrobiální geny (geny, které propůjčují rezistenci vůči antibiotikům) jsou přítomny v patogenních i nepatogenních bakteriích.

Nový přístup využívající strojové učeníumožnila odborníkům odhalit celou síť genů spojených s antimikrobiální rezistencí běžnou pro zvířata, farmářské pracovníky a životní prostředí. Je pozoruhodné, že tato síť zahrnovala geny, o kterých je známo, že způsobují rezistenci na antibiotika, stejně jako dosud neznámé geny spojené s rezistencí na léky.

Zastavěná prostředí, jako jsou oblastiintenzivní živočišná výroba jsou považovány za ideální živnou půdu pro bakterie rezistentní vůči antimikrobiálním látkám a geny rezistence vůči antibiotikům. Jejich studium má velký význam pro účinnou léčbu některých onemocnění a infekcí.

Přečtěte si více

Loví se po staletí: co víme o planetě Vulcan vedle Slunce

Fyzici experimentálně potvrdili nový základní zákon pro kapaliny

Astronomové našli zdroj záhadných rádiových výbuchů, které pocházejí z vesmíru