SARS-CoV-2 se vyvinul, aby získal mutace v spike proteinu, části viru, která vyčnívá z jeho
Uznání: Hin Hark Gan and Christine Gansalus, NYU Department of Biology.
Vědci naznačují, že právě tyto mutace v bílkovině hrotu jsou klíčovým důvodem rychlého šíření viru v některých částech světa.
V posledních měsících se objevily nové a dalšíinfekční kmeny koronaviru, což vede k novým vlnám epidemie v zemích jako Indie a Brazílie. Zhoršující se situace vyžaduje metody pro rychlou predikci nových infekčních virových kmenů. Sledování nových možností však není snadný úkol; Sekvenování genomu ukazuje, že samotný spike protein SARS-CoV-2 má například asi 5 000 možných variant.
Screening pro tak širokou škálu možnostípředstavuje velkou výzvu pro tradiční experimentální metody, poznamenávají vědci. Výhodou počítačových simulací je, že za několik dní lze snadno odhadnout sto mutací.
Vědci se obrátili na výpočetní metodukterý modeluje, jak spike protein SARS-CoV-2 rozpoznává receptor ACE2 – protein na povrchu mnoha typů buněk – aby mohl vstoupit do hostitelských buněk. prudký nárůst infekcí v Brazílii, Jižní Africe, Velké Británii a Indii.
Ukázalo to systematické posouzení možnostíSpikové mutace, které se pevně váží na receptor ACE2, se vyskytují ve dvou shlucích neboli „horkých místech“ mutací na vazebném rozhraní. Nacházejí se ve strukturálně flexibilních oblastech. To znamená, že mutace, které zvyšují vazbu, účinně přeprogramovaly konformaci páteře, aby zvýšily její schopnost rozpoznávat receptory ACE2.
Studie byla publikována v Journal of Molecular Biology.
Přečtěte si také
Autonomní dron Skyborg USAF uskutečňuje svůj první let
V Austrálii byla nalezena obrovská můra. Její rozpětí křídel je 25 cm
Vědci přeměnili betonové domy na baterie