Vědci z Moskevské státní univerzity. Lomonosov identifikoval několik nových mechanismů, které kontrolují čitelnost
Dvojitá šroubovice DNA je jako šroub.Předpokládá se, že může současně klouzat a rolovat po povrchu proteinů své schránky. Podařilo se nám ukázat, že v důsledku lokálních deformací DNA a histonových proteinů tento proces probíhá ve fázích. Nejprve se roztočí jeden kousek DNA a pak další – jakýsi mechanismus housenka-šroub.
Alexey Shaitan, jeden z autorů práce, vedoucí vědecký pracovník Moskevské státní univerzity
Celková délka všech molekul DNA z lidských chromozomůje asi 2 metry. Naše buňky komprimují vlákna DNA 10 tisíckrát, aby se vešly do jádra. Například buňka navíjí řetězec DNA kolem speciálních molekulárních „cívek“ histonových proteinů.Díky tomu může být genom zabalen velmi kompaktně, ale podstatná část řetězce DNA je skryta uvnitř těchto struktur.
Jak přesně probíhají pohyby DNA v nukleosomu,donedávna zůstával nejasný. Za tímto účelem vědci simulovali molekulární dynamiku nukleosomů na atomové úrovni na superpočítači Lomonosov-2 v rekordním čase pro počítačové simulace - 15 mikrosekund. To znamená, že superpočítač fungoval jako jakýsi výpočetní mikroskop, který umožňoval zkoumat mechanismy pohybu DNA v genomu.
Díky tomu Shaitan a jeho kolegové vystopovalijak se vlákno DNA odděluje od proteinů, jak se mění jeho struktura a jaké faktory ovlivňují pohyb řetězce nukleotidů a také jeho opětovné spojení s proteinovými spirálami.
Studie také významně přispívá k dešifrování mechanismů fungování genomu.
Přečtěte si více
Byla vytvořena první přesná mapa světa. Co se děje s ostatními?
Vrtulník vynalézavosti úspěšně startuje na Marsu
NASA řekla, jak budou dodávat vzorky Marsu na Zemi