Hvad er den "britiske" stamme af coronavirus?
Stamme 202012/01 er en stamme af SARS-CoV-2 virus, der forårsager COVID-19. Det her
I midten af december begyndte belastningen hurtigtspredning. Dette korrelerer med en betydelig stigning i antallet af COVID-19-infektioner i Storbritannien; denne stigning menes i det mindste delvist at skyldes N501Y-mutationen inden for det receptorbindende domæne af spike-glycoproteinet, som binder til ACE2-receptoren i humane celler.
Stammen er også bemærkelsesværdig for et stort antal mutationer sammenlignet med den kendte SARS-CoV-2-mutationstrend pr. December 2020.
Stammen er kendt under flere navne. Det omtales almindeligvis som "den britiske stamme af COVID-19" og "den britiske stamme af coronavirus" i regeringskommunikation og i medierne.
Denne stamme blev tidligere kaldt "den første stammeunder revision i december 2020 (VUI - 202012/01) af Public Health England, men blev nedgraderet til en Strain of Concern af Meera Chand og kolleger i en rapport offentliggjort af Public Health England den 21. december 2020.
I en rapport skrevet på vegne af konsortietGenomics COVID-19 UK (COG-UK) Andrew Rambeau og hans medforfattere henviste til denne stamme som afstamning B.1.1.7. CDC kalder også denne stamme 20B / 501Y.V1.
Lande med bekræftede tilfælde af VOC-2020/12/01
Hvor kom han fra?
Tilsyneladende fra Sydafrika.Den første rapport om denne stamme blev offentliggjort af en gruppe lokale biologer ledet af da Oliveira den 22. december 2020 - prøver blev indsamlet i begyndelsen af oktober. Da ikke alle lande har overvågningsprogrammer for nye stammer, beviser den allerførste påvisning i et land naturligvis ikke, at en variant stammer fra det nøjagtige sted, hvor den blev fundet.
Egenskaber for den "britiske" stamme
- Genetik
Mutationer i SARS-CoV-2-virussen sker ganskeOfte: Ifølge COVID-19 Genomics Consortium of Great Britain (COG-UK) er der fundet mere end 4.000 mutationer i spidsen glycoprotein alene i forskellige stammer af denne virus.
Stamme VOC-202012/01 er defineret af 23 mutationer: 13 ikke-synonyme mutationer, 4 deletioner og 6 synonyme mutationer (dvs. 17 mutationer ændrer proteiner, og 6 gør det ikke).
- Transmissibilitet
Det britiske videnskabelige rådgivende organ NERVTAG(Advisory Group on New and Emerging Respiratory Viruses) konkluderede den 18. december 2020, at de har moderat tillid til, at VUI-202012/01 er væsentligt mere overførbar end andre stammer, med data, der endnu ikke er tilstrækkelige til at drage endelige konklusioner om den underliggende mekanisme for øget overførbarhed.
Data indhentet af NERVTAG viste, at dettestamme har en "selektionskoefficient" på 0,70 (70%), forudsat et generationsinterval på 6,5 dage. Senere arbejde brugte det relative antal reproduktioner som et mål, hvilket er en indikator for udvælgelseskoefficienten.
Baseret på lidt forskellige data blev det relative antal reproduktioner ("multiplikativ fordel") bestemt til at være 1,74 (dette betyder, at denne stamme er 74% mere overførbar).
Denne stamme er blevet dominerende i London, ogi det østlige og sydøstlige England i en til to måneder. Tilsvarende hurtig vækst er blevet observeret i Irland, og det ser ud til, at denne stamme også snart vil blive dominerende der.
USA formodes at gøre det sammei marts. Bølgen i SARS-CoV-2-infektioner i starten af det nye år ses som et resultat af stammens øgede overførbarhed, mens forekomsten af andre stammer er faldende. Dette kræver strammere grænser for at undgå en hurtig eksponentiel stigning i infektioner. Transmissionskontrol af denne stamme ser til gengæld stadig svagere ud.
Første billede af en britisk virusstamme
Er vacciner effektive mod det?
Flere COVID-19-vacciner er tidligere blevet udviklet.
Men efterhånden som der sker meremutationer, skal vaccinen muligvis modificeres. SARS-CoV-2 muterer ikke så hurtigt som for eksempel influenzavirus, og de nye vacciner, der blev bevist effektive ved udgangen af 2020, er typer, der kan modificeres, hvis det er nødvendigt.
Ved udgangen af 2020, organersundhedseksperter og eksperter fra Tyskland, Storbritannien og Amerika mener, at eksisterende vacciner vil være lige så effektive mod VOC-202012/01 stammen som mod de tidligere stammer.
Den 18. december 2020 konkluderede NERVTAG, at "der i øjeblikket ikke er tilstrækkelige data til at drage nogen konklusion om denne stamme ufølsomhed over for vaccineantigener."
Indtil videre offentlig sundhedstjenesteStorbritannien har bekræftet, at der ikke er "noget bevis" for, at den nye stamme vil være resistent over for Pfizer-BioNTech-vaccinen, der i øjeblikket anvendes i det britiske vaccinationsprogram, så vaccinerede mennesker er stadig beskyttet.
Hvad er specielt ved den "britiske" stamme?
Generelt har den "britiske" stamme 29 mutationer isammenlignet med den oprindelige Wuhan-stamme. Dette antyder, at det muterer meget hurtigere end sidstnævnte, for hvilket virologer har registreret ca. to mutationer pr. Måned.
Desuden findes der mange mutationer i proteinettorner af den nye stamme, letter binding af virus til receptorer i værtscellerne. Derfor foreslår forskere, at B.1.1.7 stammen vil være mere farlig - den vil have en højere virulens og muligvis evnen til at undgå virkningen af de udviklede vacciner.
I en ny undersøgelse besluttede forfatterne at brugecomputersimuleringer til at forudsige, hvordan forskellige mutationer af den "britiske" stamme vil påvirke spredningshastigheden og infektionens sværhedsgrad såvel som selve virussens replikation og patogenese.
For at forklare den usædvanligt høje hyppighed af mutationer, der forekommer i både S spike-proteinet og det N-terminale domæne, tilbyder forskerne tre forklaringer:
- langvarig infektion med virussen hos en patient med et svækket immunsystem tillod viruset at mutere i høj hastighed;
- adaptive mutationer begyndte i dyreværter, blev overført til mennesker gennem zoonotisk overførsel og fortsatte i den menneskelige vært;
- selektiv udvælgelse, der forekommer i virussens struktur under tryk fra antistoffer.
Simuleringsresultaterne viste detstabiliteten af hydrogenbindinger i den mutante variant er højere. Dets spidsprotein danner også flere bindinger med receptoren for værtsceller, og disse bindinger varer i længere tid. Den estimerede overførselshastighed for stamme B.1.1.7 er 70% højere, og antallet af reproduktioner er 0,4 højere end for den klassiske variant.
Faren ligger ifølge forfatterne også iat ved at teste standarder, genkender revers transkriptionspolymerasekædereaktion eller RT-PCR muligvis ikke den nye stammes virale RNA. En mutationsændret stamme kan også tillade den at undgå neutralisering af antistoffer og reducere effektiviteten af vacciner.
Hvor distribueres det?
Nu - næsten over hele verden.Ifølge data fra den største database med genomer GISAID blev de fleste af de tilsvarende prøver fundet i Storbritannien, Danmark, USA, Frankrig, Spanien og Irland, der er genomer selv fra relativt velstående lande som New Zealand og Singapore. Distributionskortene kan ses her.
Med tilstedeværelsen af belastningen i Rusland er situationen ikke heltklar. Den 10. januar rapporterede Anna Popova om sin opdagelse i landet. I den største åbne internationale database GISAID over genomer af variant B.1.1.7. fra Rusland nr.
Læs mere
Se på et billede på 8 billioner pixel af Mars
Forskere har udviklet en erstatning for relativitetsteorien. Hvad er essensen af "teorien om alt"?
Abort og videnskab: hvad vil der ske med de børn, der føder