Forskere fra den tværfaglige forskningsgruppe om antimikrobiel resistens (AMR) i
Spildevandsovervågning hjælper hurtigt ogspore diskret spredningen af COVID-19. Yderligere oplysninger giver sundhedsmyndighederne mulighed for at spore pandemien på fællesskabsplan. For nylig er SARS-CoV-2-virusfragmenter fundet i boligområder i Singapore som en del af et proaktivt spildevandsovervågningsprogram. Disse oplysninger sammen med opfølgningstest gjorde det muligt for landets sundhedsministerium at reagere hurtigt på situationen.
Opdagelsen af varianter af coronavirus medspildevandsovervågning er mindre almindelig på grund af problemer med eksisterende teknologier. Næste generations sekventering til overvågning af spildevand er tidskrævende og dyr. Testene mangler også følsomhed. Et internationalt team af forskere i en ny undersøgelse forsøgte at tackle dette problem.
I en undersøgelse offentliggjort itidsskrift Environmental Science & Technology Letters forklarer forskere en innovativ molekylær detektionsmetode baseret på allelspecifik RT-qPCR, der detekterer og kvantificerer B.1.1.7 (Alpha) varianten. Det udviklede assay, testet og valideret på spildevandsprøver fra 19 amerikanske samfund, er i stand til pålideligt at detektere og kvantificere lave niveauer af B.1.1.7 (Alpha) varianten med lav krydsreaktivitet og variantandele så lave som 1 procent i blandet SARS-virus baggrunde -CoV-2.
En metode rettet mod proteinpikemutationer, der forudsiger variant B.1.1.7 (Alpha), kan implementeres ved hjælp af kommercielt tilgængelige RT-qPCR-protokoller.
Læs mere
Bremsningen af Jordens rotation forårsagede frigivelse af ilt på planeten
Astronomer ser usædvanlige strukturer i dybt rum
Se mere 60.000 år gammel neandertaler-rockart
AMR - Antimikrobiel resistens
RT -qPCR - kvantitativ PCR revers transkription.