AI hjælper med at genkende RNA-rester af gamle vira i det menneskelige genom

Tidligere undersøgelser har vist, at når virussen trænger ind i menneskets (og andre dyrs) krop, er det

 kan ændre værtens DNA ved at tilføje en delsit eget RNA. Det er også kendt, at ældgamle vira, der inficerede befolkningen for mange år siden, nogle gange efterlod rester af deres RNA i det menneskelige genom. Men at finde dem viste sig at være en vanskelig opgave på grund af det enorme antal sammenligninger, der kræves for hver "mistænkt" virus. I det nye arbejde brugte forskerne en maskinlæringsalgoritme til at løse problemet.

For at træne algoritmen brugte forskere RNA frakendte ikke-retrovirale endogene RNA-virale elementer. Ved at træne algoritmen for moderne viral RNA kunne systemet få en fornemmelse for, hvordan det ser ud som en helhed. Forskere mener, at sådanne ligheder sandsynligvis også eksisterede i gammelt RNA. Efter træning justerede forskere systemet for at forhindre så mange falske positive som muligt. De kørte det derefter på det menneskelige genom og fandt omkring 100 muligheder for yderligere overvejelse. Efter at have undersøgt dem, fandt forskerne, at mange af dem allerede var kendt, og nogle var under den tærskel, de satte som en bestå / ikke-mulighed. De har kun én mulig rest af en ukendt virus tilbage.

Senere kontrollerede forskere, om de fandt det sammeresterende viralt RNA i genomerne fra andre arter, såsom aber og chimpanser. Denne opdagelse antyder, at infektionen og yderligere DNA-ændring fandt sted for mindst 43 millioner år siden.

Forskerne bemærkede, at flere oplysninger om antikke vira og deres indvirkning på det menneskelige genom vil give indsigt i nuancerne i opførelsen af ​​moderne vira, der stadig er ukendte.

Læs mere

Abort og videnskab: hvad vil der ske med de børn, der føder

Radarer har fundet det sidste Tlingit-fort i Alaska. De har ledt efter ham i over 100 år

En tredjedel af dem, der er kommet sig efter COVID-19, vender tilbage til hospitalet. Hver ottende - dør