Forskere har opdaget fingeraftryk af mystiske vira, der gemte sig i en gammel gruppe af mikrober.
Denne uge i tidsskriftet Nature Microbiologytre artikler viet til vira fra archaea fra Asgard-gruppen blev offentliggjort på én gang. Forskere har undersøgt viruss genomer ud fra genomiske og metagenomiske data og studeret deres forhold til de mest berømte grupper af vira. De opnåede data hjalp forskerne med at gætte, hvad der præcist var funktionerne af de vira, der inficerede Asgard archaea.
Især er dette den første undersøgelsearkæiske Asgard-vira; intet var kendt før. I fremtiden kan denne forskningslinje vise, om og hvordan vira var involveret i fremkomsten af eukaryote celler på Jorden.
Generelt har archaea fra Asgard-gruppen mange gener,som koder for eukaryote proteiner. Forskere anser dem også for at være de nærmeste slægtninge til eukaryoter. Men indtil nu vidste forskerne ikke, om lighederne mellem medlemmer af Asgard-gruppen og eukaryoter udvidede sig til de vira, der inficerer dem.
Den første gruppe af forskere analyseredemetagenomiske sekvenser. De blev opnået fra dybhavs hydrotermiske aflejringer. Biologer har indsamlet seks genomer af vira, der inficerer archaea fra Asgard-gruppen. Det viste sig, at de tilhører fire vira, de hed Fenrir (Fenrir), Sköll (Skoll), Nidhogg (Nidhogg) og Ratatoskr (Ratatoskr). Alle er de skabninger fra skandinavisk mytologi.
Baseret på genomiske data, biologerantydet, at de er i stand til semi-autonom genomreplikation, reparation, epigenetisk modifikation og transkriptionel regulering. De kombinerer også træk ved bakterielle og arkæiske vira.
En anden gruppe videnskabsmænd har opnået det komplette genom af en arkæafra Asgard-gruppen og gensamlede genomet af stamme LCB_4, som blev betragtet som en basal gruppe af phylum Odinarchaeota. Biologer har opdaget sekvenserne af to vira, de fik navnet Huginn og Muninn (Hugin og Munin er et par ravne i skandinavisk mytologi, der flyver rundt i Midgards verden og rapporterer til guden Odin om, hvad der sker). Vira relateret til dem blev fundet i genomerne af andre prokaryoter, herunder archaea fra Asgard-gruppen.
Det tredje værk er viet til metagenomisk samling 20nye arkæiske vira fra Asgard-gruppen fra sedimentprøver. Ved at kombinere fylogenetisk analyse med søgninger efter CRISPR-loci i metagenomiske data opdelte forskerne de fundne vira i tre grupper på familieniveau.
I sidste ende var forskerne i stand til at finde ud af funktionerne af kun nogle af virusgenerne. Funktionerne af langt de fleste gener er stadig ukendte.
Asgard eller Asgardarchaeota - formodeset superfylum bestående af en gruppe arkæer, der omfatter Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota og Heimdallarchaeota. Det ser ud til, at eukaryoter stammer fra Asgard, i den gren, der indeholder Heimdallarchaeota. Det betyder, at arkæer fra Asgard-gruppen, foreslår mange biologer, er tættest på forfædrene til alle organismer, der har cellekerner. De kunne have bidraget til fremkomsten af komplekst liv
Forskningsresultaterne kan findes her, her og her.
Læs mere:
Se på den himmelske "Titanic", der vil køre på atomkraft
NASA fandt ud af, hvordan man leder efter liv på Mars: eksperimentet viste, hvor det kunne være
Astronomer har fundet planeter, der er forskellige fra Jorden, men egnede til liv
</ p>