Til dato har den nye type coronavirus forårsaget 3,9 millioner dødsfald på verdensplan. I begyndelsen af pandemien
Nu har en Seattle-baseret forsker opdaget slettede filer fra Google Cloud, der afslører 13 delvise genetiske sekvenser fra nogle af de tidligste tilfælde af COVID-19 i Wuhan.
Sekvenser vælter ikke balancenfra eller fra mange teorier om, hvordan SARS-CoV-2 opstod. For eksempel støtter de ikke teorien om, at virussen lækkede fra et højsikkerhedslaboratorium i Wuhan. Alligevel tyder beviser på, at den nye coronavirus cirkulerede, selv før det første store udbrud blev opdaget på et fisk og skaldyrsmarked i provinsen Kina.
For at finde ud af nøjagtigt hvordan og hvor der sketeen virus, skal forskere finde den såkaldte forløbervirus, som alle andre stammer stammer fra. Indtil videre er de tidligste sekvenser for det meste taget fra sager på Huanan Seafood Market i Wuhan. Det blev oprindeligt spekuleret i, at SARS-CoV-2 først dukkede op i slutningen af december 2019. Imidlertid havde sager fra begyndelsen af december til november samme år ingen markedsforbindelse. Dette indikerer, at virussen stammer fra et andet sted.
Sager, der findes på markedet, omfatter tremutationer, der er fraværende i virusprøver, der er påvist uger senere uden for markedet. Virus uden mutationer matchede tættere koronavirus, der findes i hestesko-flagermus. Forskere er overbeviste om, at det nye coronavirus på en eller anden måde stammer fra flagermus, så det er logisk at antage, at stamfaderen heller ikke havde disse mutationer.
Og nu Jesse Bloom fra Medical InstituteHoward Hughes i Seattle opdagede, at de slettede sekvensdata (sandsynligvis nogle af de tidligste prøver af virussen) også er blottet for disse mutationer.
For omkring et år siden var 241 genetiskesekvensen fra coronaviruspatienter er forsvundet i Sequence Read Archive, en online database vedligeholdt af National Institutes of Health (NIH).
Bloom bemærkede de manglende sekvenser,da jeg snuble over et regneark i en undersøgelse, der blev offentliggjort i maj 2020 i PeerJ. De var en del af Wuhan University-projektet PRJNA612766 og blev angiveligt uploadet til arkivet. Forskeren søgte i arkivdatabasen efter sekvenser og modtog beskeden "Elementer ikke fundet."
Hans undersøgelse afslørede, at den slettedesekvenserne er samlet af Wuhan University Hospital. Samtidig antyder fortrykket af en undersøgelse, der er offentliggjort baseret på disse sekvenser, at de blev taget fra prøver af næsepinde fra ambulante patienter med mistanke om COVID-19 i begyndelsen af epidemien.
Bloom kunne ikke finde nogen forklaring på, hvorfor sekvenserne blev fjernet, og hans e-mails til undersøgelsesforfatterne ikke blev besvaret.
Videnskabsmanden bemærker, at "der er ingen overbevisende videnskabeliggrunde til at slette data." Pointen er, at sekvenserne fuldt ud svarer til prøverne beskrevet i arbejdet. Der er ingen rettelser i dokumentet. Derudover understreger undersøgelsen, at prøverne blev opnået frivilligt fra individer, og sekventering viser ingen tegn på plasmidkontamination eller kontaminering af prøverne. "Det virker sandsynligt, at sekvenserne blev fjernet for at skjule deres eksistens," konkluderer Bloom.
En artikel med hans resultater blev offentliggjort på biorxiv preprint-webstedet.
Læs mere
Den største komet i historien ses i solsystemet: det er næsten en planet
Ny metode omdanner straks kulstof til grafen eller diamanter
Fundet en billig måde at redde centre for megabyer mod overophedning