Et hold ledet af forskere fra Paderborn, Tyskland, professor Thomas D. Kühne og professor Christian
Forskere har overvundet den exascale udfordringmens man simulerer SARS-CoV-2 spike-proteinet i en ægte videnskabelig computerapplikation. De fik gennembruddet ved hjælp af Perlmutter-supercomputeren ved National Energy Research Scientific Computing Center (NERSC) i USA.
Perlmutter er i øjeblikket den femteden hurtigste computer i verden. Grundlaget var en ny modelleringsmetode, som Plössl og Kühne har udviklet i de senere år og integreret i open source kvantekemiprogrammet CP2K.
I en verden af højtydende computingAntallet af dobbelt-præcision (64-bit) flydende komma aritmetiske operationer udført pr.
Modellering af SARS-CoV-2-spidsproteinet medVed at bruge 4.400 GPU-acceleratorer overskred forskerne exaflops-tærsklen og nåede 1,1 exaflops. Til sammenligning tager et simuleringstrin 42 sekunder for 83 millioner atomer, hvilket betyder, at processen udfører cirka 47 × 10 til 18. potens af flydende kommaoperationer. Uden hukommelseskrav ville en sådan beregning have taget omkring 13 timer med det første petaflop-system, Roadrunner-supercomputeren i 2008, og omkring 1,5 år med det første teraflop-system, ASCI Red, brugt i 1997.
Læs mere
Abekopper er ved at blive en global virus: hvorfor det overføres så hurtigt
Der sker noget mærkeligt i universet: hvordan man forklarer uoverensstemmelser i Hubble-konstanten
Diagnose på et øjeblik: hvordan IT ændrer sundhedsvæsenet