Das Projekt verwendet den Perturb-seq-Ansatz, der es Ihnen ermöglicht, die Auswirkungen des Ein- oder Ausschaltens zu verfolgen
Beim Arbeiten mit der Perturb-seq-TechnologieForscher nehmen mit CRISPR-Cas9 genetische Veränderungen an Zellen vor und verwenden dann die Einzelzell-RNA-Sequenzierung, um Informationen über die RNA zu sammeln, die als Ergebnis dieser genetischen Veränderung exprimiert wird. Die Forscher stellen fest, dass RNA jeden Aspekt des Zellverhaltens kontrolliert, sodass diese Methode hilft, die meisten zellulären Auswirkungen minimaler genetischer Veränderungen zu entschlüsseln.
In einer neuen Studie verwendeten Wissenschaftlermenschliche Blutkrebszelllinien sowie von der Netzhaut stammende, nicht krebsartige Zellen, um Perturb-seq an mehr als 2,5 Millionen Zellen durchzuführen. Basierend auf den erhaltenen Daten erstellten Genetiker eine umfassende Karte, die Genotypen mit Phänotypen verknüpft.
Die Autoren glauben, dass die Ergebnisse des Projekts hilfreich sein werdenZukunftsforschung. Beispielsweise haben die Ersteller der integrierten Karte selbst die Daten verwendet, um die zellulären Auswirkungen von Genen mit unbekannten Funktionen zu untersuchen, um die Reaktion von Mitochondrien auf Stress zu untersuchen und um nach Genen zu suchen, die Chromosomenverlust oder -gewinn verursachen, ein Phänotyp, der gewesen ist in der Vergangenheit schwer zu studieren.
„Ich denke, dieser Datensatz wird Menschen, die aus verschiedenen Bereichen der Biologie kommen, alle Arten von Analysen ermöglichen, an die wir noch nicht einmal gedacht haben“, sagt Tom Norman, Co-Autor der Studie.
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