Μέχρι σήμερα, ο νέος τύπος κορωνοϊού έχει προκαλέσει 3,9 εκατομμύρια θανάτους παγκοσμίως. Στην αρχή της πανδημίας
Τώρα, ένας ερευνητής που εδρεύει στο Σιάτλ ανακάλυψε διαγραμμένα αρχεία από το Google Cloud που αποκαλύπτουν 13 μερική γενετική αλληλουχία από μερικές από τις πρώτες περιπτώσεις κορωνοϊού στο Γουχάν.
Οι σεκάνς δεν ανατρέπουν την ισορροπίααπό ή από πολλές θεωρίες σχετικά με το πώς προήλθε ο SARS-CoV-2. Για παράδειγμα, δεν υποστηρίζουν τη θεωρία ότι ο ιός διέρρευσε από ένα εργαστήριο υψηλής ασφάλειας στη Γουχάν. Ωστόσο, τα στοιχεία δείχνουν ότι ο νέος κοροναϊός κυκλοφορούσε ακόμη και πριν ανακαλυφθεί το πρώτο μεγάλο ξέσπασμα σε μια αγορά θαλασσινών στην επαρχιακή Κίνα.
Για να προσδιορίσουμε ακριβώς πώς και πού συνέβηέναν ιό, οι επιστήμονες πρέπει να βρουν τον λεγόμενο πρόδρομο ιό από τον οποίο προέρχονται όλα τα άλλα στελέχη. Μέχρι στιγμής, οι πρώτες ακολουθίες έχουν ληφθεί ως επί το πλείστον από περιπτώσεις στην αγορά θαλασσινών Huanan στο Wuhan. Αρχικά υποτίθεται ότι ο SARS-CoV-2 εμφανίστηκε για πρώτη φορά στα τέλη Δεκεμβρίου 2019. Ωστόσο, οι περιπτώσεις από τις αρχές Δεκεμβρίου έως τον Νοέμβριο του ίδιου έτους δεν είχαν καμία σχέση με την αγορά. Αυτό δείχνει ότι ο ιός προήλθε από διαφορετική τοποθεσία.
Οι περιπτώσεις που βρέθηκαν στην αγορά περιλαμβάνουν τρειςμεταλλάξεις που απουσιάζουν από δείγματα ιών που εντοπίστηκαν εβδομάδες αργότερα εκτός αγοράς. Οι ιοί χωρίς μεταλλάξεις ταίριαζαν περισσότερο με τους κορωνοϊούς που βρέθηκαν σε νυχτερίδες πετάλου. Οι επιστήμονες είναι πεπεισμένοι ότι ο νέος κορονοϊός κατά κάποιον τρόπο προήλθε από νυχτερίδες, οπότε είναι λογικό να υποθέσουμε ότι ούτε ο πρόγονος δεν είχε αυτές τις μεταλλάξεις.
Και τώρα ο Jesse Bloom από το Ιατρικό ΙνστιτούτοΟ Howard Hughes στο Σιάτλ ανακάλυψε ότι τα διαγραμμένα δεδομένα αλληλουχίας (πιθανώς μερικά από τα πρώτα δείγματα του ιού) στερούνται επίσης αυτών των μεταλλάξεων.
Περίπου ένα χρόνο πριν, 241 γενετικάΗ ακολουθία από ασθενείς με κορονοϊό έχει εξαφανιστεί από το Αρχείο Ακολουθίας Ανάγνωσης, μια ηλεκτρονική βάση δεδομένων που διατηρείται από τα Εθνικά Ινστιτούτα Υγείας (NIH).
Ο Μπλουμ παρατήρησε τις ακολουθίες που έλειπαν,όταν έπεσα πάνω σε ένα υπολογιστικό φύλλο σε μια μελέτη που δημοσιεύτηκε τον Μάιο του 2020 στο PeerJ. Ταν μέρος του προγράμματος PRJNA612766 του Πανεπιστημίου της Γουχάν και υποτίθεται ότι μεταφορτώθηκαν στο αρχείο. Ο επιστήμονας έψαξε τη βάση δεδομένων αρχείων για αλληλουχίες και έλαβε το μήνυμα "Τα στοιχεία δεν βρέθηκαν".
Η έρευνά του αποκάλυψε ότι το διαγράφηκεοι ακολουθίες συλλέγονται από το Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Wuhan. Ταυτόχρονα, το προστύπωμα της μελέτης, που δημοσιεύθηκε με βάση αυτές τις αλληλουχίες, υποδηλώνει ότι ελήφθησαν από δείγματα ρινικών επιχρισμάτων από εξωτερικούς ασθενείς με υποψία COVID-19 στην αρχή της επιδημίας.
Ο Μπλουμ δεν μπόρεσε να βρει καμία εξήγηση για το γιατί αφαιρέθηκαν οι ακολουθίες και δεν απαντήθηκαν τα μηνύματα ηλεκτρονικού ταχυδρομείου του στους συγγραφείς της μελέτης.
Ο επιστήμονας σημειώνει ότι «δεν υπάρχει καμία πειστική επιστημονικήλόγοι διαγραφής δεδομένων." Το θέμα είναι ότι οι ακολουθίες αντιστοιχούν πλήρως στα δείγματα που περιγράφονται στην εργασία. Δεν υπάρχουν διορθώσεις στο έγγραφο. Επιπλέον, η μελέτη τονίζει ότι τα δείγματα ελήφθησαν εθελοντικά από άτομα και η αλληλούχιση δεν δείχνει στοιχεία μόλυνσης με πλασμίδιο ή μόλυνσης των δειγμάτων. «Φαίνεται πιθανό ότι οι ακολουθίες αφαιρέθηκαν για να κρύψουν την ύπαρξή τους», καταλήγει ο Bloom.
Ένα άρθρο με τα ευρήματά του δημοσιεύτηκε στον ιστότοπο preprint biorxiv.
Διαβάστε περισσότερα
Ο μεγαλύτερος κομήτης στην ιστορία φαίνεται στο ηλιακό σύστημα: είναι σχεδόν ένας πλανήτης
Η νέα μέθοδος μετατρέπει αμέσως τον άνθρακα σε γραφένιο ή διαμάντια
Βρέθηκε ένας φθηνός τρόπος για να σώσετε τα κέντρα των μεγαλοτήτων από την υπερθέρμανση