Οι επιστήμονες έχουν μελετήσει πάνω από 1.000 συνδυασμούς μεταλλάξεων σε πρωτεΐνες αγκαθιού κοραναϊού

Ο SARS-CoV-2 έχει εξελιχθεί για να αποκτήσει μεταλλάξεις στην πρωτεΐνη ακίδα, το τμήμα του ιού που δρα ωςμε το δικό του

Οι μεταλλάξεις σε αυτό το τμήμα του κοροναϊού αυξάνονταιτην ικανότητά του να συνδέεται με ανθρώπινα κύτταρα ή να αποφεύγει τα αντισώματα.Μια νέα μελέτη από τα Κέντρα Γονιδιωματικής και Βιολογίας Συστημάτων στο Πανεπιστήμιο της Νέας Υόρκης και το Πανεπιστήμιο της Νέας Υόρκης στο Αμπού Ντάμπι χρησιμοποιείΟ στόχος είναι να εντοπιστούν οι εκδόσεις του ιού που συνδέονται πιο ισχυρά με τον υποδοχέα ACE2 ή αντιστέκονται στα αντισώματα.

Πίστωση: Hin Hark Gan and Christine Gansalus, NYU Department of Biology.

Οι επιστήμονες προτείνουν ότι αυτές οι μεταλλάξεις στην πρωτεΐνη αιχμής είναι ο βασικός λόγος για την ταχεία εξάπλωση του ιού σε ορισμένα μέρη του κόσμου.

Τους τελευταίους μήνες, νέα και άλλαμολυσματικά στελέχη του κορονοϊού, οδηγώντας σε νέα κύματα της επιδημίας σε χώρες όπως η Ινδία και η Βραζιλία. Η επιδεινούμενη κατάσταση απαιτεί μεθόδους για την ταχεία πρόβλεψη νέων μολυσματικών ιικών στελεχών. Αλλά η παρακολούθηση νέων επιλογών δεν είναι εύκολη υπόθεση. Η αλληλουχία γονιδιώματος δείχνει ότι μόνο η πρωτεΐνη αιχμής SARS-CoV-2, για παράδειγμα, έχει περίπου 5.000 πιθανές παραλλαγές.

Προβολή για ένα τόσο ευρύ φάσμα επιλογώναποτελεί μια τεράστια πρόκληση για τις παραδοσιακές πειραματικές μεθόδους, σημειώνουν οι επιστήμονες. Το πλεονέκτημα των προσομοιώσεων υπολογιστή είναι ότι εκατό μεταλλάξεις μπορούν εύκολα να εκτιμηθούν σε λίγες ημέρες.

Οι επιστήμονες έχουν στραφεί σε μια υπολογιστική μέθοδο που μοντελοποιεί πώς αναγνωρίζει η πρωτεΐνη ακίδα του SARS-CoV-2Ο υποδοχέας ACE2 - μια πρωτεΐνη στην επιφάνεια πολλών τύπων κυττάρων - εισέρχεται στα κύτταρα ξενιστές. Αξιολόγησαν 1.003 συνδυασμούς μεταλλάξεων στις πρωτεΐνες ακίδες του κοροναϊού, συμπεριλαμβανομένων εκείνων που οδήγησαν σε αύξηση των λοιμώξεων στη Βραζιλία, τη Νότια Αφρική, το Ηνωμένο Βασίλειο και την Ινδία.

Μια συστηματική αξιολόγηση των επιλογών έδειξε ότιΜεταλλάξεις ακίδων που συνδέονται σφιχτά με τον υποδοχέα ACE2 εμφανίζονται σε δύο ομάδες, ή «καυτά σημεία» μεταλλάξεων στη διασύνδεση σύνδεσης. Βρίσκονται σε δομικά εύκαμπτες περιοχές. Αυτό σημαίνει ότι οι μεταλλάξεις που αυξάνουν τη δέσμευση έχουν επαναπρογραμματίσει αποτελεσματικά τη διαμόρφωση της σπονδυλικής στήλης για να ενισχύσουν την ικανότητά της να αναγνωρίζει τους υποδοχείς ACE2.

Η μελέτη δημοσιεύεται στο Εφημερίδα της Μοριακής Βιολογίας.

Διαβάστε επίσης

Το αυτόνομο drone του Skyborg της USAF κάνει την πρώτη του πτήση

Ένας τεράστιος σκώρος βρέθηκε στην Αυστραλία. Το άνοιγμα των φτερών της είναι 25 εκατοστά

Οι επιστήμονες μετέτρεψαν τα σπίτια από σκυρόδεμα σε μπαταρίες