Hasta la fecha, el nuevo tipo de coronavirus ha causado 3,9 millones de muertes en todo el mundo. Al comienzo de la pandemia
Ahora, un investigador con sede en Seattle ha descubierto archivos eliminados de Google Cloud que revelan 13 secuencias genéticas parciales de algunos de los primeros casos de COVID-19 en Wuhan.
Las secuencias no inclinan la balanzade o de muchas teorías sobre cómo se originó el SARS-CoV-2. Por ejemplo, no respaldan la teoría de que el virus se filtró desde un laboratorio de alta seguridad en Wuhan. Sin embargo, la evidencia sugiere que el nuevo coronavirus ya circulaba incluso antes de que se descubriera el primer brote importante en un mercado de mariscos en la provincia de China.
Para señalar exactamente cómo y dónde sucedióun virus, los científicos necesitan encontrar el llamado virus precursor del que se originaron todas las demás cepas. Hasta ahora, las primeras secuencias se han tomado principalmente de casos en el mercado de mariscos de Huanan en Wuhan. Originalmente se especuló que el SARS-CoV-2 apareció por primera vez a fines de diciembre de 2019. Sin embargo, los casos de principios de diciembre a noviembre de ese año no tenían conexión con el mercado. Esto indica que el virus se originó en una ubicación diferente.
Los casos encontrados en el mercado incluyen tresmutaciones que están ausentes en las muestras de virus detectadas semanas después fuera del mercado. Los virus sin mutaciones coincidían más estrechamente con los coronavirus que se encuentran en los murciélagos en herradura. Los científicos confían en que el nuevo coronavirus se originó de alguna manera en los murciélagos, por lo que es lógico suponer que el progenitor tampoco tenía estas mutaciones.
Y ahora Jesse Bloom del Instituto MédicoHoward Hughes en Seattle descubrió que los datos de la secuencia eliminada (probablemente algunas de las primeras muestras del virus) también carecían de estas mutaciones.
Hace aproximadamente un año, 241 genéticala secuencia de pacientes con coronavirus ha desaparecido del Sequence Read Archive, una base de datos en línea mantenida por los Institutos Nacionales de Salud (NIH).
Bloom notó las secuencias faltantes,cuando me topé con una hoja de cálculo en un estudio publicado en mayo de 2020 en PeerJ. Formaban parte del proyecto PRJNA612766 de la Universidad de Wuhan y supuestamente se cargaron en el archivo. El científico buscó secuencias en la base de datos del archivo y recibió el mensaje "Elementos no encontrados".
Su investigación reveló que el borradolas secuencias son recopiladas por el Hospital Universitario de Wuhan. Al mismo tiempo, la preimpresión del estudio, publicada en base a estas secuencias, sugiere que se tomaron de muestras de hisopos nasales de pacientes ambulatorios con sospecha de COVID-19 al comienzo de la epidemia.
Bloom no pudo encontrar ninguna explicación de por qué se eliminaron las secuencias y sus correos electrónicos a los autores del estudio no fueron respondidos.
El científico señala que “no hay evidencia científica convincenteRazones para eliminar datos." La cuestión es que las secuencias corresponden plenamente a las muestras descritas en el trabajo. No hay correcciones en el documento. Además, el estudio enfatiza que las muestras se obtuvieron voluntariamente de individuos y la secuenciación no muestra evidencia de contaminación de plásmidos o contaminación de las muestras. "Parece probable que las secuencias hayan sido eliminadas para ocultar su existencia", concluye Bloom.
Se publicó un artículo con sus hallazgos en el sitio web de preimpresión de biorxiv.
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