La herramienta desarrollada por el equipo se llama CShaper.
Es una poderosa herramienta informática que puede
Segmentar y analizar sistemáticamente imágenes de células a nivel de representantes específicos.Esto es muy importante para el estudio de la división celular, así como para las funciones de las células y los genes.Texto de trabajo
Para crear un dispositivo informático, los biólogos estudiaron cómo crecen los animalesa partir de una sola célula, un óvulo fertilizado o a través de innumerables divisiones celulares.En particular, querían conocer ciertas funciones de los genes, como qué genes están involucradosen la división de las células en la formación de diferentes órganos o que causaDivisiones celulares anormales que hacen que los tumores crezcan.
Para hacer esto, los investigadores primero obtuvieron imágenes de las células, su "árbol genealógico".A continuación, "apagan" (eliminan) el gen de la secuencia de ADN y lo comparanDos árboles genealógicos para analizar los cambios en las células e inferir las funciones de los genes.Después de eso, el experimento se repite, pero con diferentes genes.
Los biólogos utilizaron embriones en el estudio.Caenorhabditis elegans es un tipo de gusano que comparte muchas características biológicas con los humanos, por lo que puede usarse para estudiar el crecimiento tumoral en humanos.
"Dado que C. elegans tiene alrededor de 20.000 genes, eso significa que se necesitarían casi 20.000 experimentos si se elige un gen a la vez.Por lo tanto, es extremadamente importante utilizar el sistema automatizado de análisis de imágenes que hemos desarrollado". Investigaciones.
Las imágenes de las células se obtienen generalmente utilizandoescaneo con un rayo láser. Los sistemas de análisis de imágenes existentes solo pueden detectar con éxito el núcleo celular, pero la imagen de la membrana celular será de mala calidad, lo que dificulta la reconstrucción de la forma celular.
Además, no existe un algoritmo fiable para segmentar fotograma a fotograma imágenes tridimensionales (es decir, imágenes cuatridimensionales) de la división celular.La segmentación de imágenes es un proceso importante en la visión artificial que incluyeDivida la entrada visual en segmentos para simplificar el análisis de imágenes.Pero los investigadores tienen que pasar cientos de horas etiquetando manualmente muchas imágenes de células.
Nuevo desarrollo que CShaper puede detectarmembranas celulares, generar formas celulares en el espacio 3D y, lo que es más importante, segmentar automáticamente imágenes celulares a nivel celular.
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