Un equipo dirigido por científicos de Paderborn, Alemania, el profesor Thomas D. Kühne y el profesor Christian
Los científicos han superado el desafío de la exaescalamientras se simula la proteína de pico del SARS-CoV-2 en una aplicación informática científica real. Lo lograron con la ayuda del superordenador Perlmutter del Centro Nacional de Computación Científica para la Investigación Energética (NERSC) de EE. UU.
Perlmutter es actualmente el quintoLa computadora más rápida del mundo. La base fue un nuevo método de modelado que Plössl y Kühne desarrollaron en los últimos años e integraron en el programa de química cuántica de código abierto CP2K.
En el mundo de la informática de alto rendimientoEl número de operaciones aritméticas de punto flotante de doble precisión (64 bits) realizadas por segundo es el punto de referencia para el rendimiento de las supercomputadoras: en 1984 se alcanzó por primera vez la marca de mil millones de operaciones por segundo, una cifra que todos los teléfonos inteligentes actuales han superado.
Modelado de la proteína de pico del SARS-CoV-2 conUtilizando 4.400 aceleradores GPU, los científicos superaron el umbral de exaflops y alcanzaron 1,1 exaflops. A modo de comparación, un paso de simulación tarda 42 segundos para 83 millones de átomos, lo que significa que el proceso realiza aproximadamente 47 × 10 a la 18ª potencia de operaciones de punto flotante. Sin los requisitos de memoria, dicho cálculo habría llevado unas 13 horas con el primer sistema petaflop, el superordenador Roadrunner en 2008, y alrededor de 1,5 años con el primer sistema teraflop, ASCI Red, utilizado en 1997.
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