El SARS-CoV-2 ha evolucionado hasta adquirir mutaciones en la proteína de pico, la parte del virus que sobresale de su
Crédito: Hin Hark Gan y Christine Gansalus, Departamento de Biología de la Universidad de Nueva York.
Los científicos sugieren que son estas mutaciones en la proteína de pico las que son la razón clave de la rápida propagación del virus en algunas partes del mundo.
En los últimos meses, nuevos y máscepas contagiosas del coronavirus, dando lugar a nuevas oleadas de la epidemia en países como India y Brasil. El empeoramiento de la situación requiere métodos para la predicción rápida de nuevas cepas virales infecciosas. Pero hacer un seguimiento de las nuevas opciones no es una tarea fácil; La secuenciación del genoma muestra que la proteína de pico de SARS-CoV-2 sola, por ejemplo, tiene alrededor de 5.000 variantes posibles.
Detección de una gama tan amplia de opcionesplantea un gran desafío a los métodos experimentales tradicionales, señalan los científicos. La ventaja de las simulaciones por ordenador es que se pueden estimar fácilmente cien mutaciones en unos pocos días.
Los científicos recurrieron a un método computacionalque modela cómo la proteína de pico del SARS-CoV-2 reconoce el receptor ACE2, una proteína en la superficie de muchos tipos de células, para ingresar a las células huésped. Evaluaron 1,003 combinaciones de mutaciones en las proteínas de pico del coronavirus, incluidas aquellas que condujeron a un aumento de las infecciones en Brasil, Sudáfrica, el Reino Unido y la India.
Una evaluación sistemática de las opciones mostró queLas mutaciones de pico que se unen estrechamente al receptor ACE2 ocurren en dos grupos o "puntos calientes" de mutaciones en la interfaz de unión. Están ubicados en regiones estructuralmente flexibles. Esto significa que las mutaciones que aumentan la unión han reprogramado eficazmente la conformación de la columna para mejorar su capacidad para reconocer los receptores ACE2.
El estudio fue publicado en Revista de Biología Molecular.
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