Tieteidenvälisen mikrobiresistenssin (AMR) tutkimusryhmän tutkijat
Jäteveden valvonta auttaa nopeasti jaseurata huomaamattomasti COVID-19-leviämistä. Lisätietojen avulla terveysviranomaiset voivat seurata pandemiaa yhteisön tasolla. Viime aikoina Singaporessa asuinalueilta on löydetty SARS-CoV-2-viruksen fragmentteja osana ennakoivaa jätevedenvalvontaohjelmaa. Nämä tiedot yhdessä seurantatestien kanssa antoivat maan terveysministeriölle mahdollisuuden reagoida nopeasti tilanteeseen.
Kuitenkin havaitseminen muunnelmia koronaviruksen kanssajäteveden seuranta on harvinaisempaa nykyisten tekniikoiden ongelmien vuoksi. Jäteveden seurannan seuraavan sukupolven sekvensointi on aikaa vievää ja kallista. Testeistä puuttuu myös herkkyys. Kansainvälinen tutkijaryhmä uudessa tutkimuksessa pyrki ratkaisemaan tämän ongelman.
Vuonna julkaistussa tutkimuksessaaikakauslehti Environmental Science & Technology Lettersissä tutkijat selittävät innovatiivisen molekyylin havaitsemismenetelmän, joka perustuu alleelispesifiseen RT-qPCR:ään, joka havaitsee ja kvantifioi B.1.1.7 (Alpha) -variantin. Kehitetty määritys, joka on testattu ja validoitu 19 yhdysvaltalaisen yhteisön jätevesinäytteillä, pystyy luotettavasti havaitsemaan ja kvantifioimaan B.1.1.7 (Alpha) -variantin alhaiset tasot, joilla on alhainen ristireaktiivisuus ja muunnelmien osuudet vain 1 prosentti sekoitettuna. SARS-viruksen taustat -CoV-2.
Menetelmä, joka on suunnattu proteiinipiikkimutaatioille, jotka ennustavat varianttia B.1.1.7 (alfa), voidaan toteuttaa käyttämällä kaupallisesti saatavia RT-qPCR-protokollia.
Lue lisää
Maapallon pyörimisen hidastuminen aiheutti hapen vapautumista planeetalle
Tähtitieteilijät havaitsevat epätavallisia rakenteita syvässä avaruudessa
Katso lisää 60 000 vuotta vanhaa neandertalin kalliotaidetta
AMR - mikrobilääkeresistenssi
RT -qPCR - kvantitatiivinen PCR -käänteiskopiointi.