AI auttaa tunnistamaan antiikin virusten RNA-tähteet ihmisen genomissa

Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että kun virus joutuu ihmisen (ja muun eläimen) elimistöön, se

 voi muuttaa isännän DNA:ta lisäämällä osanomaa RNA:ta. Tiedetään myös, että muinaiset virukset, jotka tartuttavat väestöä monta vuotta sitten, jättivät joskus RNA:staan ​​jäänteitä ihmisen genomiin. Niiden löytäminen osoittautui kuitenkin vaikeaksi tehtäväksi, koska jokaisen "epäillyn" viruksen kohdalla tarvittiin valtava määrä vertailuja. Uudessa työssä tutkijat käyttivät ongelman ratkaisemiseen koneoppimisalgoritmia.

Algoritmin kouluttamiseksi tutkijat käyttivät RNA: tatunnetut ei-retroviraaliset endogeeniset RNA-viruselementit. Harjoittamalla modernin virus-RNA: n algoritmia järjestelmä voisi saada tuntuman miltä se näyttää kokonaisuudessaan. Tutkijat uskovat, että tällaisia ​​yhtäläisyyksiä todennäköisesti esiintyi myös muinaisessa RNA: ssa. Koulutuksen jälkeen tutkijat säätelivät järjestelmää estääkseen mahdollisimman monta väärää positiivista. Sitten he juoksivat sen ihmisen genomiin ja löysivät noin 100 vaihtoehtoa jatkokäsittelyä varten. Tutkittuaan ne tutkijat havaitsivat, että monet heistä olivat jo tunnettuja, ja jotkut olivat kynnyksen alapuolella, jonka he asettivat hyväksyttäväksi / hylätyksi -vaihtoehdoksi. Heillä on jäljellä vain yksi mahdollinen jäännös tuntemattomasta viruksesta.

Myöhemmin tutkijat tarkasivat löytäneetkö samanjäännösviruksen RNA muiden lajien, kuten apinoiden ja simpanssien, genomeissa. Tämä löytö viittaa siihen, että infektio ja uudet DNA-muutokset tapahtuivat ainakin 43 miljoonaa vuotta sitten.

Tutkijat totesivat, että lisätietoja muinaisista viruksista ja niiden vaikutuksista ihmisen genomiin antaa käsityksen nykyaikaisten virusten käyttäytymisen vivahteista, joita ei vielä tunneta.

Lue lisää

Abortti ja tiede: mitä tapahtuu synnyttäville lapsille

Tutkat ovat löytäneet viimeisen Tlingitin linnoituksen Alaskasta. He ovat etsineet häntä yli 100 vuotta

Kolmasosa COVID-19: stä toipuneista palaa sairaalaan. Joka kahdeksas - kuolee