Tähän mennessä uudentyyppinen koronavirus on aiheuttanut 3,9 miljoonaa kuolemaa maailmanlaajuisesti. Pandemian alussa
Nyt Seattlessa työskentelevä tutkija on löytänyt poistetut tiedostot Google Cloudista, jotka paljastavat 13 osittaista geneettistä sekvenssiä joistakin varhaisimmista COVID-19 -tapauksista Wuhanissa.
Jaksot eivät horjuta tasapainoamonista SARS-CoV-2:n syntyä koskevista teorioista. He eivät esimerkiksi tue teoriaa, jonka mukaan virus olisi vuotanut Wuhanissa sijaitsevasta erittäin suojatusta laboratoriosta. Silti todisteet viittaavat siihen, että uusi koronavirus levisi jo ennen kuin ensimmäinen suuri epidemia havaittiin Kiinan provinssin kalamarkkinoilla.
Selvittää tarkalleen miten ja missä tapahtuivirus, tutkijoiden on löydettävä niin kutsuttu prekursorivirus, josta kaikki muut kannat ovat peräisin. Toistaiseksi aikaisimmat sekvenssit on otettu enimmäkseen tapauksista Huanan Seafood Marketissa Wuhanissa. Alun perin oletettiin, että SARS-CoV-2 ilmestyi ensimmäisen kerran joulukuun lopulla 2019. Kyseisen vuoden joulukuun alusta marraskuuhun liittyvillä tapauksilla ei kuitenkaan ollut markkinayhteyttä. Tämä osoittaa, että virus on peräisin eri sijainnista.
Markkinoilta löytyneitä tapauksia on kolmeviikkoja myöhemmin markkinoiden ulkopuolella havaituista viruksenäytteistä puuttuvat mutaatiot. Virukset, joilla ei ole mutaatioita, sopivat paremmin hevosenkengän lepakoiden koronaviruksiin. Tutkijat ovat vakuuttuneita siitä, että uusi koronavirus on jotenkin peräisin lepakoista, joten on loogista olettaa, että esivanhemmalla ei myöskään ollut näitä mutaatioita.
Ja nyt Jesse Bloom lääketieteellisestä instituutistaHoward Hughes Seattlessa havaitsi, että poistetuista sekvenssitiedoista (luultavasti joitain viruksen varhaisimmista näytteistä) puuttuu myös nämä mutaatiot.
Noin vuosi sitten 241 geneettistäkoronaviruspotilaiden sekvenssi on kadonnut online-järjestyslukuhistoriasta, jota ylläpitää National Institutes of Health (NIH).
Bloom huomasi puuttuvat jaksot,kun törmäsin taulukkoon tutkimuksessa, joka julkaistiin toukokuussa 2020 PeerJ: ssä. He olivat osa Wuhanin yliopiston projektia PRJNA612766 ja oletettavasti ladattiin arkistoon. Tutkija etsinyt sekvenssejä arkistotietokannasta ja sai viestin "Kohteita ei löydy".
Hänen tutkimuksensa paljasti, että poistetutsekvenssit kerää Wuhanin yliopistollinen sairaala. Samanaikaisesti näiden sekvenssien perusteella julkaistu tutkimustulos viittaa siihen, että ne otettiin epidemian alkaessa näytteistä nenäpyyhkeistä avohoitopotilailta, joilla epäillään olevan COVID-19.
Bloom ei löytänyt mitään selitystä sille, miksi sekvenssit poistettiin ja hänen sähköpostinsa tutkimuksen tekijöille ei vastattu.
Tiedemies toteaa, että "ei ole vakuuttavaa tieteellistäsyitä tietojen poistamiseen." Asia on siinä, että sekvenssit vastaavat täysin työssä kuvattuja näytteitä. Asiakirjassa ei ole korjauksia. Lisäksi tutkimuksessa korostetaan, että näytteet on saatu vapaaehtoisesti yksilöiltä, eikä sekvensointi osoita näyttöä plasmidi- tai näytteiden kontaminaatiosta. "Näyttää todennäköiseltä, että sekvenssit poistettiin niiden olemassaolon peittämiseksi", Bloom päättää.
Artikkeli hänen tuloksistaan julkaistiin biorxiv preprint -verkkosivustolla.
Lue lisää
Historian suurin komeetta nähdään aurinkokunnassa: se on melkein planeetta
Uusi menetelmä muuttaa hiilin välittömästi grafeeniksi tai timanteiksi
Löytyi edullinen tapa säästää megakaupunkien keskuksia ylikuumenemiselta