Mikä on Etelä-Afrikan koronaviruksen kanta?
Kanta 501.V2 tai "Afrikkalainen kanta" tai "Eteläafrikkalainen"
Kannan ominaisuudet
- Leviää aktiivisesti nuorten keskuudessa
Tutkijat ja virkamiehet sanoivat sentämän kannan esiintyvyys oli korkeampi nuorten keskuudessa, joilla ei ollut samanaikaisia sairauksia, ja muihin kantoihin verrattuna se todennäköisesti aiheuttaa vakavia sairauksia tällaisissa tapauksissa.
- Aiheuttaa toisen aallon vaaran Afrikan maissa
Myös Etelä-Afrikan terveysministeriöуказало, что этот штамм может быть движущей силой второй волны пандемии COVID-19 в стране из-за того, что штамм распространяется быстрее, чем другие более ранние штаммы вируса.
- Suuri määrä mutaatioita
Tutkijat huomauttivat, että tämä kanta sisältääuseita mutaatioita, jotka mahdollistavat sen kiinnittymisen helpommin ihmissoluihin johtuen kolmesta mutaatiosta viruksen piikkiglykoproteiinin reseptoria sitovassa domeenissa (RBD): N501Y (aminohappo asparagiini (N) korvataan aminohapolla tyrosiini (Y) sijainti 501), K417N ja E484K.
Kaksi näistä mutaatioista (E484K ja N501Y) ovat reseptoria sitovan domeenin (RBD) reseptoria sitovassa motiivissa (RBM).
N501Y-mutaatio löydettiin myös kannasta202012/01, jaettu laajalti Isossa-Britanniassa. Kaksi muuta mutaatiota, jotka löytyvät 501.V2: sta, E484K ja K417N, puuttuvat Ison-Britannian kannasta. Lisäksi 501.V2: sta puuttuu 69-70del-mutaatio, joka löydettiin toisesta kannasta.
Havaitseminen
Uusi kanta löydettiin sekvensoimallatäydellinen genomi. Useat tämän linjan genomiset sekvenssit toimitettiin GISAID-geenisekvenssitietokantaan, esimerkiksi sekvenssi EPI_ISL_678597.
Kansainvälinen jakelu
23. joulukuuta Matt Hancock ilmoitti, että kaksi ihmistäEtelä-Afrikasta Isoon-Britanniaan matkustaneet saivat 501.V2-tartunnan. joulukuuta 28. Tätä kantaa löydettiin kahdelta henkilöltä Sveitsissä ja yhdellä henkilöllä Suomessa.
29. joulukuuta kanta havaittiin matkustajassa,Etelä-Afrikasta Japaniin ja kansainväliseltä matkailijalta Queenslandissa, Australiassa. Kanta löydettiin Sambiassa 30. joulukuuta. Joulukuun 31. päivänä se havaittiin myös Ranskassa Etelä-Afrikasta palaavasta matkustajasta.
Ensimmäinen tammikuun 2021 infektiokanta tunnistettiin Etelä-Koreassa. Itävalta ilmoitti ensimmäisestä tapauksestaan tämän kannan tartunnasta sekä neljästä Britannian kannan infektiotapauksesta 4. tammikuuta. 8. tammikuuta 2021 Irlanti ilmoitti 3 tapauksesta tätä kantaa, jotka kaikki liittyivät matkustamiseen Etelä-Afrikasta.
Herkkyys rokotteille
The Telegraph -sanomalehti kertoi 4. tammikuuta 2021,Oxfordin immunologi Sir John Bell uskoo, että uusi eteläafrikkalainen kanta on "iso kysymysmerkki", koska se saattaa olla vastustuskykyinen rokotteille, mikä tuhoaa toiveet ja korvaa ne pelolla.
Samana päivänä rokotustieteen professori Shabir Madhikertoi CBS Newsille, ettei ole varmaa, että uusi kanta 501.V2 pystyy "ohittamaan" rokotteen suojan, mutta hän uskoo, että se "voi olla vähemmän tehokas".
Muita mutaatioita piikkiproteiinissa kannassa 501.Readingin yliopiston solumikrobiologian apulaisprofessori Simon Clarke tunnisti V2:t huolestuttavaksi tekijäksi, koska ne "voivat tehdä viruksesta vähemmän herkkiä rokotteen aiheuttamalle immuunivasteelle".
Warwickin yliopiston virologi Lawrence Young totesi myös, että tämän kannan moninkertaiset piikkimutaatiot "voivat johtaa jonkin verran paeta immuunijärjestelmän suojasta".
Useat tutkimukset osoittavat, että tämä kanta on kiertänyt neutraloivan moniklonaalisen vasta-aineen, joka kohdistuu SARS-CoV-2-piikkiproteiiniin.
Ugur Sakhin, BioNTechin toimitusjohtaja,sanoi, että lisätutkimuksia tarvitaan sen varmistamiseksi, että yhtiön nykyinen rokote toimii 501.V2-kantaa vastaan, mutta jos rokotetta on muutettava, yritys voisi tehdä sen noin 6 viikossa.
Guardian ilmoitti 8. tammikuuta, että Pfizer-rokote jaCOVID-19: n BioNTech on osoittanut 20 verikokeella tehdyissä testeissä, että se pystyy tarjoamaan suojaa 501.V2-kantaa vastaan. Suojauksen tarkan asteen määrittämiseksi tarvitaan lisätutkimuksia.
Moderna aikoo testata uutta versiota rokotteestaan, joka on erityisesti modifioitu suojaamaan 501.V2-kantaa vastaan, koska Novavax on ryhtynyt vastaaviin toimenpiteisiin.
Ad26-rokotteen kliinisen tutkimuksen mukaan.COV2.S, Johnson & Johnsonin mukaan sen tehokkuus Etelä-Afrikassa on 15 % pienempi kuin Yhdysvalloissa (57 % ja 72 %, vastaavasti); ero johtuu todennäköisesti 501.V2-kannan esiintyvyydestä Etelä-Afrikassa.
Toinen rokotteen tutkimus (Novavaxin NVX-CoV2373) osoitti 60 prosentin tehokkuuden (HIV-negatiivisilla osallistujilla) Etelä-Afrikassa verrattuna 90 prosentin tehokkuuteen Isossa-Britanniassa.
Reutersin mukaan Pfizer-rokote on vain hieman vähemmän tehokas 501.V2: ta vastaan. AstraZeneca aikoo mukauttaa rokotteensa tähän kantaan, ja uuden rokotteen odotetaan olevan valmis syksyyn 2021 mennessä.
Moderna ilmoitti 24. helmikuuta 2021 rokotteensa uuden version kliinisten kokeiden aloittamisesta. Uusi versio on suunniteltu erityisesti 501.V2:ta vastaan.
Kannan mutaatiot
Tutkijat ovat löytäneet kahdeksan mutaatiota "Etelä-Afrikan" kannan piikkiproteiinista. Tämä proteiini on vastuussa viruksen pääsystä soluun.
- N501Y
Yksi näistä mutaatioista, N501Y, on myös läsnä"Brittiläinen" -kanta B.1.1.7 ja liittyy lisääntyneeseen sitoutumiseen ihmisen reseptoriin ACE2, johon SARS-CoV-2 on kiinnittynyt solun pinnalle.
- E484K
Toinen mutaatio, E484K, reseptorin sitoutumisessaviruksen domeeni (RBD) määrittää 501Y.V2: n lisääntyneen resistenssin neutraloiville vasta-aineille, mikä voi vaikuttaa negatiivisesti piikkiproteiiniin kohdistuvien COVID-19-rokotteiden tehokkuuteen.
Piikkimutaatio E484K on linkitetty tapaukseenuudelleeninfektio kannalla 501.V2 SARS-CoV-2 Brasiliassa, jonka tutkijat uskovat olevan ensimmäinen tällainen uudelleeninfektio kannalla, joka sisälsi tämän mutaation.
Missä kanta on nyt jaettu?
Virus 501.V2 aiheutti epidemian toisen aallon Etelä-Afrikassa, joka huipentui tammikuun puolivälissä. Se esiintyi Botswanassa, Sambiassa, Keniassa ja Gambiassa sekä Yhdysvalloissa, Kanadassa, Australiassa, Kiinassa, Israelissa ja osissa Euroopan maat.
Lisäksi kanta löydettiin Venäjän alueelta toistaiseksi yhtenä määränä.
Lue lisää
Uranus on saanut aurinkokunnan omituisimman planeetan tilan. Miksi?
Fyysikot ovat luoneet analogin mustasta aukosta ja vahvistaneet Hawkingin teorian. Minne se johtaa?
Abortti ja tiede: mitä tapahtuu synnyttäville lapsille