Tiimin kehittämä työkalu on nimeltään CShaper.
Se on tehokas tietojenkäsittelytyökalu, joka voi
Segmentoi ja analysoi järjestelmällisesti solujen kuvia tiettyjen edustajien tasolla.Tämä on erittäin tärkeää solujen jakautumisen sekä solujen ja geenien toiminnan tutkimisessa.Työteksti
Tietokonelaitteen luomiseksi biologit tutkivat, miten eläimet kasvavatyhdestä solusta, hedelmöittyneestä munasolusta tai lukemattomien solunjakautumisten kautta.Erityisesti he halusivat tietää tiettyjä geenien toimintoja, kuten mitkä geenit ovat mukanasolujen jakautumisessa eri elinten muodostumisessa tai joka aiheuttaaepänormaalit solujen jakautumiset, jotka aiheuttavat kasvainten kasvua.
Tätä varten tutkijat saivat ensin kuvia soluista - niiden "sukupuusta".Sitten he "sammuttavat" (poistavat) geenin DNA-sekvenssistä ja vertaavatKaksi sukupuuta solujen muutosten analysoimiseksi ja geenitoimintojen päättelemiseksi.Tämän jälkeen koe toistetaan, mutta eri geeneillä.
Biologit käyttivät tutkimuksessa alkioitaCaenorhabditis elegans on eräänlainen mato, jolla on monia biologisia ominaisuuksia ihmisten kanssa, joten sitä voidaan käyttää kasvaimen kasvun tutkimiseen ihmisillä.
"Kun otetaan huomioon, että C. elegansilla on noin 20 000 geeniä, se tarkoittaa, että se vaatisi lähes 20 000 koetta, jos valitset yhden geenin kerrallaan.Siksi on erittäin tärkeää käyttää kehittämäämme automaattista kuva-analyysijärjestelmää." Tutkimukset.
Solukuvat saadaan yleensä käyttämälläskannaus lasersäteellä. Olemassa olevat kuva-analyysijärjestelmät pystyvät havaitsemaan onnistuneesti vain solun ytimen, mutta solukalvon kuva on heikkolaatuinen, mikä vaikeuttaa solun muodon rekonstruointia.
Lisäksi ei ole olemassa luotettavaa algoritmia solunjakautumisen kolmiulotteisten kuvien (eli neliulotteisten kuvien) segmentoimiseksi kehyksittäin.Kuvan segmentointi on tärkeä prosessi konenäössä, joka sisältääJaa visuaalinen syöte segmentteihin kuva-analyysin yksinkertaistamiseksi.Mutta tutkijoiden on käytettävä satoja tunteja manuaalisesti merkitsemällä monia solukuvia.
CShaperin uusi kehitys voi havaita solukalvoja, luoda solumuotoja kolmiulotteisessa tilassa ja mikä tärkeintä, segmentoida solukuvat automaattisesti solutasolla.
Lue lisää
Vaarallinen ilmaston lämpeneminen alkaa seitsemän vuoden kuluttua
Abortti ja tiede: mitä tapahtuu synnyttäville lapsille
Katso kauneimmat kuvat Hubbleista. Mitä kaukoputki on nähnyt 30 vuoden aikana?