Merivesinäytteet auttoivat löytämään 5 500 uutta RNA-virusta

Uuden työn tekijät yhdistivät koneoppimisanalyysin perinteisiin opiskelumenetelmiin

evoluutiota ja tunnisti 5500 uutta RNA-viruslajia. Ne edustavat kaikkia viittä tunnettua RNA-virustyyppiä. Työnsä aikana tutkijat tutkivat 35 000 vesinäytettä.

Laajin RNA-virusten kokoelma kuuluu sukuun, jota kirjoittajat ehdottivat kutsuvaksi Taraviricotaksi. Sen edustajat löytyvät melkein kaikista näytteistä.

RNA-virukset ovat varmasti tärkeitä, mutta me yleensäTutkimme vain pientä osaa niistä - useita satoja, jotka vahingoittavat ihmisiä, kasveja ja eläimiä. Haluamme tutkia niitä systemaattisesti laajassa mittakaavassa.

Matthew Sullivan on mikrobiologian professori Ohion osavaltion yliopistossa.

Mikrobit edistävät merkittävästi kaikkien kehitystäelämä planeetalla, ja virukset, jotka tartuttavat tai ovat vuorovaikutuksessa niiden kanssa, vaikuttavat eri tavoin mikro-organismien toimintaan. Tämän tyyppisillä viruksilla uskotaan olevan kolme päätehtävää: tappaa soluja, muuttaa tapaa, jolla tartunnan saaneet solut hallitsevat resursseja, ja siirtää geenejä isännästä toiseen.

Tutkijoiden mukaan opiskelu on tärkeäävirusten monimuotoisuus ja runsaus maailman valtamerissä: tämä auttaa selittämään, kuinka meren mikrobit vaikuttavat valtamerien sopeutumiseen ilmastonmuutokseen. Valtameret imevät puolet ihmisten tuottamasta hiilidioksidista ilmakehästä, ja tämän ryhmän aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että meren virukset ovat "säätelijä", joka on vastuussa siitä, kuinka hiiltä kerääntyy valtamereen.

Uuden työn aikana ryhmä löysi satoja uusiaRNA-virukset, jotka kuuluvat olemassa oleviin tyyppeihin. Mutta analyysi paljasti myös tuhansia muita lajeja, jotka he ryhmittelivät viiteen uuteen fylaan: Taraviricota, Pomiviricota, Paraxenoviricota, Wamoviricota ja Arctiviricota.

Lue lisää:

Maan sisällä on toinen "planeetta": kuinka se pelasti syntymässä olevan elämän

Uusi tutkimus kumoaa valoenergian siirtoteorian

Tutkijat lisäsivät piitä kvanttitietokoneeseen: laskelmista tuli ennätyksellisen tarkkoja