Projektissa käytetään Perturb-seq-lähestymistapaa, jonka avulla voit seurata päälle- ja poiskytkemisen vaikutuksia
Kun työskentelet Perturb-seq-tekniikan kanssaTutkijat tekevät geneettisiä muutoksia soluihin käyttämällä CRISPR-Cas9:ää ja käyttävät sitten yhden solun RNA-sekvensointia kerätäkseen tietoa RNA:sta, joka ilmentyy tämän geneettisen muutoksen seurauksena. Tutkijat huomauttavat, että RNA hallitsee kaikkia solujen käyttäytymisen näkökohtia, joten tämä menetelmä auttaa tulkitsemaan suurimman osan minimaalisten geneettisten muutosten vaikutuksista soluihin.
Uudessa tutkimuksessa tutkijat käyttivätihmisen veren syöpäsolulinjoja sekä verkkokalvosta peräisin olevia ei-syöpäsoluja, jotta voidaan suorittaa Perturb-seq yli 2,5 miljoonalle solulle. Saatujen tietojen perusteella geneetikot rakensivat kattavan kartan, joka yhdistää genotyypit fenotyyppeihin.
Kirjoittajat uskovat, että hankkeen tulokset auttavattulevaa tutkimusta. Integroidun kartan luojat itse käyttivät dataa esimerkiksi tutkiakseen tuntemattomien toimintojen omaavien geenien vaikutuksia soluihin, mitokondrioiden vastetta stressiin ja seuloakseen geenejä, jotka aiheuttavat kromosomien menetystä tai lisääntymistä, fenotyyppiä, joka on vaikea opiskella aiemmin.
"Uskon, että tämä tietojoukko mahdollistaa kaikenlaisia analyysejä, joita emme ole vielä edes ajatelleet, ihmisille, jotka tulevat biologian eri alueilta", sanoo Tom Norman, tutkimuksen toinen kirjoittaja.
Lue lisää
Japanilaiset heittivät jättimäisen turbiinin mereen saadakseen loputtomasti energiaa virrasta.
Fuusiota voidaan parantaa: se on äärettömän energian lähde
Japanilaiset tähtitieteilijät ovat löytäneet galaksista tuntemattoman rakenteen