Kaikki virukset muuntuvat, kun ne kopioivat itseään leviäkseen. SARS-CoV-2, COVID-19:ää aiheuttava virus, ei ole
Brittiläinen muunnos, joka tunnetaan myös nimellä B.1.1.7, löydettiin ensimmäisen kerran syyskuussa 2020 ja aiheutti nyt 98% kaikista COVID-19-tapauksista Yhdistyneessä kuningaskunnassa. Se on levinnyt myös noin 100 muuhun maahan, mukaan lukien Ranska, Tanska ja Yhdysvallat.
Maailman terveysjärjestö sanooettä B.1.1.7 on yksi monista huolenaiheista yhdessä muiden kanssa, joka syntyy Etelä-Afrikassa ja Brasiliassa. "Virusvaihtoehdot Yhdistyneessä kuningaskunnassa, Etelä-Afrikassa ja Brasiliassa ovat tarttuvampia ja helpompi päästä eroon immuniteetista kuin alkuperäinen virus", kertoo Victor Padilla-Sanchez, Amerikan katolisen yliopiston tutkija. "Meidän on ymmärrettävä, miksi ne ovat tarttuvampia ja monissa tapauksissa tappavampia."
Kaikissa kolmessa variantissa on tapahtunut muutoksia piikkiproteiinissaan - osassa virusta, joka kiinnittyy ihmissoluihin. Tämän seurauksena ne tartuttavat paremmin solut ja leviävät.
Tutkimusartikkelissa Research-lehdessäIdeas and Outcomes Padilla-Sánchez käsittelee Yhdistyneen kuningaskunnan ja Etelä-Afrikan muunnelmia yksityiskohtaisesti. Hän esittää laskennallisen analyysin mutatoituneen ACE2-reseptoriin liittyvän piikkiglykoproteiinin rakenteesta. Hänen artikkelinsa hahmottelee syyn, miksi nämä muunnelmat sitoutuvat paremmin ihmissoluihin.
”Analysoin äskettäin julkaistua rakennettapiikki SARS-CoV-2, sitoutunut ACE2-reseptoriin, ja sai selville, miksi uudet variantit ovat tarttuvampia6, hän sanoi. "Nämä tulokset saatiin käyttämällä UC San Franciscon Chimera-ohjelmistoa ja molekyylidynamiikkasimulaatioita käyttäen Texas Advanced Computing Center (TACC) Frontera-supertietokonetta."
Padilla-Sanchez huomasi, että brittiläinen varianttion monia mutaatioita piikkiglykoproteiinissa. Mutta tärkeintä on yksi mutaatio, N501Y, reseptoria sitovassa domeenissa, joka on vuorovaikutuksessa ACE2-reseptorin kanssa.
"N501Y-mutaatio tarjoaa paljon korkeammansitoutumisen tehokkuus, mikä puolestaan tekee viruksesta tarttuvamman. Tätä vaihtoehtoa hallitsee Iso-Britannia ja se leviää muihin maihin ympäri maailmaa ”, hän sanoi.
Etelä-Afrikan variantti koronaviruksesta ilmestyiLokakuussa 2020 ja sillä on tärkeämpiä muutoksia piikkisessä oravassa. Tämä tekee siitä vaarallisemman kuin brittiläinen versio. Se sisältää avaimutaation E484K. Se auttaa virusta välttämään vasta-aineita ja immuunijärjestelmän osia, jotka voivat taistella koronavirusta vastaan aiemman infektion tai rokotteen kokemuksen perusteella. Tämän seurauksena keho ei voi taistella virusta vastaan.
Padilla-Sánchez suoritti rakenneanalyysin tutkimallaviruksen kiderakenne. Hänen mukaansa nykyiset rokotteet eivät välttämättä ole tehokkaita brittiläisiä ja eteläafrikkalaisia muunnelmia vastaan. "He tarvitsevat omat rokotteensa. Tarvitsemme niin monta rokotetta kuin on muunnelmia", tutkija päättää.
Lue lisää
Fyysikot ovat luoneet analogin mustasta aukosta ja vahvistaneet Hawkingin teorian. Minne se johtaa?
Tutkijat ovat löytäneet Odderonin myyttisen hiukkasen
Salaperäisin luonnonilmiö. Mistä pallon salama tulee ja miten se on vaarallista?