TALEN-genomin muokkaustyökalu on viisi kertaa parempi kuin CRISPR-Cas9

Fragile X -oireyhtymä, sirppisoluanemia, beeta-talassemia ja muut sairaudet ovat

Tutkimuksen suorittamisen jälkeen tutkijat päättelivät, että tällaisissa tiheästi pakatuissa genomin osissa työkaluTALEN-muokkaus on tehokkaampaa kuin perinteinen CRISPR/Cas9.Biologit raportoivat havainnoistaanLehdessäLuontoviestintä.

Uutta tutkimusta johtaneen Illinoisin yliopiston kemian ja biomolekyylitekniikan professorin Humin Zhaon mukaan löytö vahvistaa"Genomin muokkaustyökaluja tarvitaan laajempi valikoima, joka kattaa kaikki genomin osat.

"CRISPR on erittäin tehokas työkalu, joka mullisti geenitekniikan", Zhao selittää. "Mutta hänellä on vielä joitain rajoituksia."

Zhao ja hänen kollegansa käyttivät fluoresoivaayhden molekyylin mikroskopia, jotta voidaan tarkkailla suoraan, miten kaksi genomin muokkaustyökalua toimii elävissä nisäkässoluissa. Fluoresoivien markkereiden avulla tutkijat pystyivät mittaamaan, kuinka kauan CRISPR: n ja TALENin kuluminen DNA: ta pitkin kesti, sekä havaita ja leikata kohdealueet.

"Havaitsimme , että CRISPR toimii paremmin genomin vähemmän haavoittuvilla alueilla, mutta TALEN voi "Näihin geeneihin pääsy heterokromatiinin alueella on parempi kuin CRISPR", Zhao sanoi."Olemme myös nähneet , että TALENilla voi olla parempi muokkaustehokkuus kuin CRISPR:llä.Se voi leikata DNA:n ja tehdä sitten muutoksia tehokkaammin."

Yhteensä TALEN oli viisi kertaatehokkaampi kuin CRISPR useissa kokeissa. Tulokset johtavat joka tapauksessa parempiin lähestymistapoihin genomin eri osien kohdentamiseen, Zhao päättelee: "Joko voimme käyttää TALENia tietyissä sovelluksissa tai voimme yrittää parantaa CRISPR-suorituskykyä heterokromatiinilla."

Lue lisää

Abortti ja tiede: mitä tapahtuu synnyttäville lapsille

Tutkat ovat löytäneet viimeisen Tlingitin linnoituksen Alaskasta. He ovat etsineet häntä yli 100 vuotta

Kolmasosa COVID-19: stä toipuneista palaa sairaalaan. Joka kahdeksas - kuolee

Illinoisin yliopisto, Urbana-Champaign, UIUC- suurin Illinoisin yliopiston kampuksilla. Perustettu vuonna 1867. Sijaitsee yhdistyneissä kaupungeissa Urbana ja Champaign Illinoisin keskustassa, USA.

Heterokromatiini - kromatiinin alueet, jotka ovat kondensoituneessa (kompaktissa) tilassa solusyklin aikana. Heterokromaattisen DNA: n piirre on sen erittäin heikko transkriptiivisuus.

Transkriptioaktivaattorin kaltaiset efektorin nukleaasit ( TALENit) edustavatovat restriktioentsyymejä, jotka voidaan muokata leikkaamaan tiettyjä DNA-sekvenssejä.

CRISPR - bakteerien ja arkkien erityislokit,joka koostuu suorista toistuvista sekvensseistä, jotka on erotettu ainutlaatuisilla sekvensseillä. Välikappaleet lainataan vieraista geneettisistä elementeistä, joita solu on kohdannut.

Cas9 (CRISPR:ään liittyvä proteiini 9,CRISPR-assosioitunut proteiini) on ohjaava RNA-ohjattu endonukleaasi, joka liittyy adaptiiviseen immuunijärjestelmään CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats) useissa bakteereissa, erityisestiStreptococcus pyogenes.S. pyogeneskäyttää Cas9:ää vieraan DNA:n, kuten bakteriofagin tai plasmidi-DNA:n, tallentamiseen, tarkastamiseen ja leikkaamiseen.