Les scientifiques ont compris comment utiliser les antivitamines pour créer des antibiotiques

Les antivitamines sont des substances qui inhibent la fonction biologique des vraies vitamines.Certains d’entre eux

ont une structure chimique similaire à celle des vraies vitamines, dont elles bloquent l’actionPour cette étude, l’équipe du professeur Kai Tittman du Göttingen Center for Molecular Biosciences de l’Université de Göttingen a travaillé avec le groupe du professeur Bert de Groot de l’Institut Max Planck de chimie biophysique de Göttingen et du professeur Taj Begley de l’Université Texas A&M (États-Unis).

Ensemble, ils ont étudié le mécanisme d'action surniveau atomique de vitamine B1 anti-vitamine naturelle. Certaines bactéries sont capables de produire une forme toxique de cette vitamine B1 vitale pour tuer les bactéries concurrentes. Cet anti-vitamine particulier n'a qu'un seul atome en plus de la vitamine naturelle dans un endroit apparemment sans importance, et une question de recherche fascinante était de savoir pourquoi l'action de la vitamine est toujours empêchée ou «empoisonnée».

L'équipe de Tittmann a utilisé la cristallographieprotéines à haute résolution pour étudier comment l'anti-vitamine supprime une protéine importante dans le métabolisme central des bactéries. Les chercheurs ont découvert que la «danse du proton» qui est couramment observée dans les protéines fonctionnelles cesse presque complètement de fonctionner et que la protéine ne fonctionne plus. «Un seul atome supplémentaire dans l'anti-vitamine agit comme un grain de sable dans un système d'engrenage complexe, bloquant sa mécanique finement réglée», explique Tittmann. Il est intéressant de noter que les protéines humaines fonctionnent relativement bien avec les antivitamines et continuent de fonctionner. Le chimiste de Groot et son équipe ont utilisé des simulations informatiques pour comprendre pourquoi. «Les protéines humaines ne se lient pas du tout aux antivitamines, soit elles ne sont pas« empoisonnées »», conclut le scientifique.

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