Qu’est-ce que la souche « britannique » du coronavirus ?
Variété 202012/01 est une souche du virus SARS-CoV-2 qui cause le COVID-19. Ce
À la mi-décembre, la tension a commencé à s'atténuer rapidement.propagé. Cela est en corrélation avec une augmentation significative du taux d’infections au COVID-19 au Royaume-Uni ; On pense que cette augmentation est au moins en partie due à la mutation N501Y dans le domaine de liaison au récepteur de la glycoprotéine de pointe, qui se lie au récepteur ACE2 dans les cellules humaines.
La souche se distingue également par un grand nombre de mutations par rapport à la tendance connue des mutations SARS-CoV-2 en décembre 2020.
La souche est connue sous plusieurs noms. Elle est communément appelée « souche britannique du COVID-19 » et « souche britannique du coronavirus » dans les communications gouvernementales et dans les médias.
Cette souche était auparavant appelée « la première soucheen cours d'examen en décembre 2020 (VUI - 202012/01) par Public Health England, mais a été rétrogradé au rang de souche préoccupante par Meera Chand et ses collègues dans un rapport publié par Public Health England le 21 décembre 2020.
Dans un rapport rédigé au nom du ConsortiumGenomics COVID-19 UK (COG-UK) Andrew Rambeau et ses co-auteurs ont qualifié cette souche de lignée B.1.1.7. Le CDC appelle également cette souche 20B / 501Y.V1.
Pays avec des cas confirmés de COV-2020/12/01
D'où est-ce qu'il venait?
Apparemment d'Afrique du Sud.Le premier rapport sur cette souche a été publié par un groupe de biologistes locaux dirigé par da Oliveira le 22 décembre 2020 - des échantillons ont été collectés début octobre. Étant donné que tous les pays n'ont pas de programmes de surveillance des nouvelles souches, la toute première détection dans un pays ne prouve pas, bien entendu, qu'un variant provenait de l'endroit exact où il a été trouvé.
Propriétés de la souche « britannique »
- La génétique
Les mutations du virus SARS-CoV-2 se produisent assezSouvent: selon le COVID-19 Genomics Consortium of Great Britain (COG-UK), plus de 4000 mutations ont été trouvées dans la glycoprotéine de pointe seule dans différentes souches de ce virus.
La souche VOC-202012/01 est définie par 23 mutations: 13 mutations non synonymes, 4 délétions et 6 mutations synonymes (c'est-à-dire que 17 mutations changent les protéines et 6 ne le font pas).
- Transmissibilité
Organisme consultatif scientifique britannique NERVTAG(Groupe consultatif sur les virus respiratoires nouveaux et émergents) a conclu le 18 décembre 2020 qu'il avait une confiance modérée dans le fait que VUI-202012/01 est significativement plus transmissible que les autres souches, les données n'étant pas encore suffisantes pour tirer des conclusions définitives sur le mécanisme sous-jacent de l'augmentation transmissibilité.
Les données obtenues par NERVTAG ont montré quela souche a un « coefficient de sélection » de 0,70 (70 %), en supposant un intervalle de génération de 6,5 jours. Des travaux ultérieurs ont utilisé le nombre relatif de reproductions comme mesure, qui est un indicateur du coefficient de sélection.
Sur la base de données légèrement différentes, le nombre relatif de reproductions (« avantage multiplicatif ») a été déterminé à 1,74 (cela signifie que cette souche est 74 % plus transmissible).
Cette variété est devenue dominante à Londres, etdans l'est et le sud-est de l'Angleterre pendant un à deux mois. Une croissance rapide similaire a été observée en Irlande, et il semble que cette souche y deviendra bientôt dominante également.
Les États-Unis sont censés faire de mêmeen mars. La flambée des infections au SRAS-CoV-2 au début de la nouvelle année est considérée comme le résultat de la transmissibilité accrue de la souche, tandis que l'incidence des autres souches diminue. Cela nécessite des limites plus strictes pour éviter une augmentation exponentielle rapide des infections. Le contrôle de la transmission de cette souche, à son tour, semble de plus en plus faible.
Première image d'une souche britannique du virus
Les vaccins sont-ils efficaces contre cela?
Plusieurs vaccins COVID-19 ont été développés dans le passé.
Cependant, à mesure que d'autres choses se produisentmutations, le vaccin devra peut-être être modifié. Le SRAS-CoV-2 ne mute pas aussi rapidement que les virus de la grippe, par exemple, et les nouveaux vaccins qui se sont révélés efficaces fin 2020 sont des types qui peuvent être modifiés si nécessaire.
À la fin de 2020, les corpsdes experts en santé et des experts d'Allemagne, du Royaume-Uni et d'Amérique estiment que les vaccins existants seront aussi efficaces contre la souche VOC-202012/01 que contre les souches précédentes.
Le 18 décembre 2020, le NERVTAG a conclu que "les données sont actuellement insuffisantes pour tirer des conclusions sur l'insensibilité de cette souche aux antigènes vaccinaux".
Jusqu'à présent service de santé publiqueLe Royaume-Uni a confirmé qu'il n'y a «aucune preuve» que la nouvelle souche sera résistante au vaccin Pfizer-BioNTech actuellement utilisé dans le programme de vaccination britannique, de sorte que les personnes vaccinées sont toujours protégées.
Quelle est la particularité de la variété « britannique » ?
En général, la souche «britannique» a 29 mutations danspar rapport à la souche originale de Wuhan. Cela suggère qu'il mute beaucoup plus rapidement que ce dernier, pour lequel les virologues ont enregistré environ deux mutations par mois.
De plus, de nombreuses mutations trouvées dans la protéineles épines de la nouvelle souche facilitent la liaison du virus aux récepteurs des cellules hôtes. Par conséquent, les scientifiques suggèrent que la souche B.1.1.7 sera plus dangereuse - elle aura une virulence plus élevée et, éventuellement, la capacité d'échapper à l'action des vaccins développés.
Dans une nouvelle étude, les auteurs ont décidé d'utiliserdes simulations informatiques pour prédire comment les différentes mutations de la souche "britannique" affecteront le taux de propagation et la gravité de l'infection, ainsi que la réplication et la pathogenèse du virus lui-même.
Pour expliquer la fréquence inhabituellement élevée de mutations se produisant à la fois dans la protéine de pointe S et dans le domaine N-terminal, les chercheurs proposent trois explications:
- une infection à long terme par le virus chez un patient dont le système immunitaire était affaibli a permis au virus de muter à un taux élevé;
- les mutations adaptatives ont commencé chez les hôtes animaux, ont été transmises aux humains par transmission zoonotique et se sont poursuivies chez l'hôte humain ;
- sélection sélective qui se produit dans la structure du virus sous la pression des anticorps.
Les résultats de la simulation ont montré quela stabilité des liaisons hydrogène dans le variant mutant est plus élevée. Sa protéine de pointe forme également plus de liaisons avec le récepteur des cellules hôtes, et ces liaisons persistent plus longtemps. Le taux de transmission estimé de la souche B.1.1.7 est 70% plus élevé et le nombre de reproductions est 0,4 supérieur à celui de la variante classique.
Le danger, selon les auteurs, réside aussi dansque, selon les normes de test, la réaction en chaîne par polymérase par transcription inverse, ou RT-PCR, peut ne pas reconnaître l'ARN viral de la nouvelle souche. En outre, une souche altérée par une mutation peut lui permettre d’échapper à la neutralisation par les anticorps et de réduire l’efficacité des vaccins.
Où est-il distribué?
Maintenant - pratiquement partout dans le monde.Selon la plus grande base de données de génomes GISAID, la plupart des échantillons correspondants ont été trouvés au Royaume-Uni, au Danemark, aux États-Unis, en France, en Espagne et en Irlande, il existe même des génomes provenant de pays relativement prospères comme la Nouvelle-Zélande et Singapour. Les cartes de distribution peuvent être consultées ici.
Avec la présence de la tension en Russie, la situation n'est pas entièrementclair. Le 10 janvier, Anna Popova a rendu compte de sa découverte dans le pays. Cependant, dans la plus grande base de données internationale ouverte GISAID des génomes de la variante B.1.1.7. de Russie no.
Lire la suite
Regardez une image de 8 trillions de pixels de Mars
Les scientifiques ont développé un substitut à la théorie de la relativité. Quelle est l'essence de la «théorie de tout»?
Avortement et science: qu'arrivera-t-il aux enfants qui accoucheront