L'IA aide à reconnaître les résidus d'ARN d'anciens virus dans le génome humain

Des études antérieures ont montré que lorsque le virus pénètre dans le corps humain (et d'autres animaux), il

 peut modifier l'ADN de l'hôte en ajoutant une partieson propre ARN. On sait également que les anciens virus qui ont infecté la population il y a de nombreuses années ont parfois laissé des restes de leur ARN dans le génome humain. Cependant, les trouver s’est avéré être une tâche difficile en raison du grand nombre de comparaisons nécessaires pour chaque virus « suspecté ». Dans le nouveau travail, les chercheurs ont utilisé un algorithme d’apprentissage automatique pour résoudre le problème.

Pour former l'algorithme, les scientifiques ont utilisé l'ARN deéléments viraux à ARN endogènes non rétroviraux connus. En entraînant l'algorithme de l'ARN viral moderne, le système pourrait avoir une idée de ce à quoi il ressemble dans son ensemble. Les chercheurs pensent que de telles similitudes existaient probablement également dans l'ancien ARN. Après la formation, les scientifiques ont peaufiné le système pour éviter autant de faux positifs que possible. Ils l'ont ensuite exécuté sur le génome humain et ont trouvé environ 100 options pour un examen plus approfondi. Après les avoir examinés, les chercheurs ont découvert que beaucoup d'entre eux étaient déjà connus et que certains étaient en dessous du seuil qu'ils avaient défini comme option réussite / échec. Il ne leur reste qu'un seul vestige possible d'un virus inconnu.

Plus tard, les scientifiques ont vérifié s'ils avaient trouvé le mêmeARN viral résiduel dans les génomes d'autres espèces, comme les singes et les chimpanzés. Cette découverte suggère que l'infection et d'autres modifications de l'ADN se sont produites il y a au moins 43 millions d'années.

Les chercheurs ont noté que plus d'informations sur les virus anciens et leur impact sur le génome humain fourniront un aperçu des nuances du comportement des virus modernes qui sont encore inconnus.

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