Des biologistes ont restauré le génome d'E. coli trouvé dans la vésicule biliaire d'une momie

La plupart des travaux sur la restauration de l'ADN d'agents pathogènes anciens sont associés à des épidémies majeures : peste, virus

variole et sources de tuberculose.Dans un nouvel article, des chercheurs ont reconstruit le code génétique d'E. coli opportuniste à partir d'un organisme ancien. Le génome d’un ancêtre d’une bactérie moderne âgé de 400 ans aidera les chercheurs à comprendre comment elle a évolué et s’est adaptée.

E. coli vit dans les intestins de personnes en bonne santédes gens et des animaux. Bien que la plupart des formes soient inoffensives, certaines souches provoquent des épidémies graves, parfois mortelles, d'intoxications alimentaires et d'infections du sang. La bactérie robuste et adaptable se révèle particulièrement résistante au traitement, notent les auteurs. E. coli agit comme un agent pathogène opportuniste qui infecte son hôte en période de stress, de maladie sous-jacente ou d'immunodéficience.

Pour leur étude, les scientifiques ont utilisérestes momifiés de Giovanni d'Avalos. Ce noble napolitain de la Renaissance mourut en 1586 à l'âge de 48 ans. Ses restes, entre autres, ont été découverts en 1983 dans l'abbaye de San Domenico Maggiore à Naples. Les chercheurs ont supposé que la cause du décès était une inflammation chronique de la vésicule biliaire due à la présence de calculs.

Lorsque nous avons examiné ces restes, il n'y avait paspreuve que cette personne avait E. coli. Contrairement à une infection comme la variole, il n'y a pas de manifestations physiologiques. Personne ne savait ce que c'était.

George Long, chercheur à l'Université McMaster, co-auteur de l'article

Les scientifiques notent que E. coli est largement répandudistribué dans le sol. Par conséquent, au cours des travaux, il a été nécessaire d'isoler soigneusement les anciens fragments de la bactérie cible, qui ont été détruits sous l'influence de l'environnement.

Malgré toutes les difficultés, les chercheurs ont réussi à reconstruire le génome à partir du matériel extrait. Il se composait d'un chromosome avec 4446 gènes et de deux plasmides putatifs avec 52 gènes.

Image de couverture : Division de paléopathologie de l'Université de Pise

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