Les scientifiques ont découvert les empreintes digitales de mystérieux virus cachés dans un ancien groupe de microbes.
Cette semaine dans la revue Nature Microbiologytrois articles consacrés aux virus des archées du groupe Asgard ont été publiés en même temps. Les scientifiques ont examiné les génomes des virus à partir de données génomiques et métagénomiques et étudié leur relation avec les groupes de virus les plus connus. Les données obtenues ont aidé les scientifiques à deviner quelles étaient exactement les fonctions des virus qui infectaient les archées d'Asgard.
Il s'agit notamment de la première étudevirus archéens Asgard; rien n'était connu auparavant. À l'avenir, cette ligne de recherche pourrait montrer si et comment des virus ont été impliqués dans l'émergence de cellules eucaryotes sur Terre.
En général, les archées du groupe Asgard possèdent de nombreux gènesqui codent pour les protéines eucaryotes. Les scientifiques les considèrent également comme les plus proches parents des eucaryotes. Cependant, jusqu’à présent, les chercheurs ne savaient pas si les similitudes entre les membres du groupe Asgard et les eucaryotes s’étendaient aux virus qui les infectent.
Le premier groupe de scientifiques analysésséquences métagénomiques. Ils ont été obtenus à partir de gisements hydrothermaux profonds. Les biologistes ont collecté six génomes de virus qui infectent les archées du groupe Asgard. Il s'est avéré qu'ils appartiennent à quatre virus, ils s'appelaient Fenrir (Fenrir), Sköll (Skoll), Nidhogg (Nidhogg) et Ratatoskr (Ratatoskr). Ce sont tous des créatures de la mythologie scandinave.
Sur la base des données génomiques, les biologistesont suggéré qu'ils sont capables de réplication semi-autonome du génome, de réparation, de modification épigénétique et de régulation transcriptionnelle. Et combinez également les caractéristiques des virus des bactéries et des archées.
Un autre groupe de scientifiques a obtenu le génome complet d'une archéedu groupe Asgard et a réassemblé le génome de la souche LCB_4, considérée comme un groupe basal du phylum Odinarchaeota. Les biologistes ont découvert les séquences de deux virus, ils ont été nommés Huginn et Muninn (Hugin et Munin sont un couple de corbeaux dans la mythologie scandinave qui volent autour du monde de Midgard et rapportent au dieu Odin ce qui se passe). Des virus qui leur sont apparentés ont été trouvés dans les génomes d'autres procaryotes, notamment les archées du groupe Asgard.
Le troisième ouvrage est consacré à l'assemblage métagénomique 20nouveaux virus archéens du groupe Asgard à partir d'échantillons de sédiments. En combinant l’analyse phylogénétique avec la recherche de loci CRISPR dans les données métagénomiques, les chercheurs ont divisé les virus trouvés en trois groupes familiaux.
En fin de compte, les chercheurs n’ont pu comprendre les fonctions que de certains gènes du virus. Les fonctions de la grande majorité des gènes sont encore inconnues.
Asgard ou Asgardarchaeota - présuméun superphylum composé d'un groupe d'archées qui comprend Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota et Heimdallarchaeota. Il semble que les eucaryotes soient originaires d'Asgard, dans la branche contenant le Heimdallarchaeota. Cela signifie que les archées du groupe Asgard, suggèrent de nombreux biologistes, sont les plus proches des ancêtres de tous les organismes dotés de noyaux cellulaires. Ils auraient pu contribuer à l’émergence d’une vie complexe
Les résultats de la recherche sont disponibles ici, ici et ici.
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