À ce jour, le nouveau type de coronavirus a causé 3,9 millions de décès dans le monde. Au début de la pandémie
Maintenant, un chercheur basé à Seattle a découvert des fichiers supprimés de Google Cloud qui révèlent 13 séquences génétiques partielles de certains des premiers cas de COVID-19 à Wuhan.
Les séquences ne font pas pencher la balancede ou de nombreuses théories sur l’origine du SRAS-CoV-2. Par exemple, ils ne soutiennent pas la théorie selon laquelle le virus aurait fui d’un laboratoire de haute sécurité à Wuhan. Pourtant, les preuves suggèrent que le nouveau coronavirus circulait avant même que la première épidémie majeure ne soit découverte sur un marché de fruits de mer dans la province chinoise.
Pour déterminer exactement comment et où s'est passévirus, les scientifiques doivent trouver le virus dit précurseur, dont toutes les autres souches sont issues. Jusqu'à présent, les premières séquences ont été principalement tirées de cas au marché des fruits de mer de Huanan à Wuhan. Il était à l'origine supposé que le SARS-CoV-2 est apparu pour la première fois fin décembre 2019. Cependant, les cas de début décembre à novembre de la même année n'avaient aucun lien avec le marché. Cela indique que le virus est originaire d'un endroit différent.
Les cas trouvés sur le marché comprennent troismutations absentes dans les échantillons de virus détectés des semaines plus tard en dehors du marché. Les virus sans mutations correspondaient plus étroitement aux coronavirus trouvés chez les chauves-souris en fer à cheval. Les scientifiques sont convaincus que le nouveau coronavirus provient en quelque sorte des chauves-souris, il est donc logique de supposer que le progéniteur n'avait pas non plus ces mutations.
Et maintenant Jesse Bloom du Medical InstituteHoward Hughes à Seattle a découvert que les données de séquence supprimées (probablement certaines des premiers échantillons du virus) étaient également dépourvues de ces mutations.
Il y a environ un an, 241 génétiquesla séquence des patients atteints de coronavirus a disparu des archives de lecture de séquences en ligne, qui sont maintenues par les National Institutes of Health (NIH).
Bloom a remarqué les séquences manquantes,quand je suis tombé sur une feuille de calcul dans une étude publiée en mai 2020 dans PeerJ. Ils faisaient partie du projet PRJNA612766 de l'Université de Wuhan et auraient été téléchargés dans les archives. Le scientifique a recherché des séquences dans la base de données d'archives et a reçu le message « Articles non trouvés ».
Son enquête a révélé que la suppressionles séquences sont collectées par l'hôpital universitaire de Wuhan. Dans le même temps, la préimpression de l'étude, publiée sur la base de ces séquences, suggère qu'elles ont été prélevées à partir d'échantillons d'écouvillonnages nasaux de patients ambulatoires suspectés de COVID-19 au début de l'épidémie.
Bloom n'a pu trouver aucune explication quant à la raison pour laquelle les séquences ont été supprimées et ses courriels aux auteurs de l'étude n'ont pas reçu de réponse.
Le scientifique note qu '«il n'existe aucune preuve scientifique convaincanteraisons de la suppression des données. Le fait est que les séquences correspondent pleinement aux échantillons décrits dans l'ouvrage. Il n'y a aucune correction dans le document. De plus, l’étude souligne que les échantillons ont été obtenus volontairement auprès d’individus et que le séquençage ne montre aucune preuve de contamination plasmidique ou de contamination des échantillons. "Il semble probable que les séquences aient été supprimées pour dissimuler leur existence", conclut Bloom.
Un article contenant ses découvertes a été publié sur le site Web de prépublication biorxiv.
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