Les scientifiques du monde entier utilisent maintenant des protéines poreuses pour séquencer le matériel génétique
Par conséquent, nous voulions créer de nouvelles protéines nanoporeuses à partir de zéro, qui pourraient servir, par exemple, à améliorer le séquençage de l’ADN.Anastasia Vorobyova, auteure principale de l’étude et directrice de l’Institute for Protein Design de la faculté de médecine de l’Université de Washington
Les auteurs expliquent que les bactéries sont enfermées dans une membrane extérieure spéciale qui les protège.Les protéines qui sont intégrées dans ces membranes facilitent le mouvement de divers produits chimiques à l’intérieur et à l’extérieur de la cellule.
Ces pores protéiques naturels ont une structure similaire à l’échelle nanométrique : une feuille plateun écureuil qui s’enroule sur lui-même, formant un tonneau à travers lequelpassent par d’autres molécules, y compris les nutriments, les vitamines et même les brins d’ADN.C’est ce qu’on appelle un tronc bêta transmembranaire.
Pour créer de nouveaux troncs bêta transmembranaires, Vorobyova et ses collègues ont utilisé un logiciel de conception moléculaire pour développer des structures possibles.Les protéines artificielles les plus réussies et les plus crédibles contiennent huit brins de rubans.
Ensuite, les auteurs ont testé si des versions améliorées des protéines de synthèse pouvaient être incorporées dans des membranes lipidiques artificielles.Il s’est avéré qu’ils peuvent le faire sans l’aide de protéines auxiliaires.
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