Grâce aux technologies d’analyse et de séquençage, les scientifiques ont créé un graphique de l’évolution de la bactérie Enterococcus faecalis. Ce
Les résultats, publiés aujourd'hui dans NatureDes communications montrent que cette bactérie, E. faecalis, a la capacité de s'adapter très rapidement aux pressions de sélection. Par exemple, l’utilisation de produits chimiques dans l’agriculture, ainsi que le développement de nouveaux médicaments, qui ont provoqué l’émergence de différentes souches d’une même bactérie. En raison de sa présence répandue, les scientifiques suggèrent de dépister ce type de bactérie lors de son admission à l’hôpital, de la même manière que les autres superbactéries. L’objectif est de réduire la probabilité qu’une infection se développe et se propage dans le système de santé.
Enterococcus faecalis est une bactérie courantequi, chez la plupart des gens, se trouve dans le tractus intestinal et ne nuit pas au propriétaire. Cependant, si le système immunitaire est affaibli et pénètre dans la circulation sanguine, cela peut entraîner de graves complications.
Dans les hôpitaux, résistant àsouches résistantes aux antibiotiques d'E. faecalis, et on pensait initialement que l'utilisation généralisée d'antibiotiques et d'autres contrôles dans les hôpitaux modernes conduisait au développement de ces souches.
Dans une nouvelle étude, des scientifiques du Wellcome InstituteSanger, l'Université d'Oslo et l'Université de Cambridge ont analysé environ 2 000 spécimens d'E. faecalis de 1936 à nos jours. Ils ont utilisé des isolats sanguins de patients et des échantillons de selles d’animaux et de personnes en bonne santé.
En utilisant le séquençage du génome (y comprischromosomes et plasmides) grâce à la technologie Oxford Nanopore, l’équipe a cartographié le chemin évolutif de la bactérie. De plus, ils ont créé une chronologie et une carte du développement de ses différentes souches. Y compris ceux qui sont désormais reconnus comme résistants aux antibiotiques.
Il s’est avéré que des souches résistantes sont apparues plus tôt que ne le pensaient les scientifiques. Cela s'est produit avant l'utilisation généralisée des antibiotiques.
Les chercheurs ont découvert que l'agriculture et les premiersles pratiques médicales telles que l'utilisation de l'arsenic et du mercure ont influencé l'évolution de certaines souches. En plus de cela, des souches similaires aux variantes résistantes aux antibiotiques qui menacent maintenant les hôpitaux ont été trouvées chez des oiseaux sauvages. L'étude a montré avec quel succès ce type de bactérie s'adapte et se transforme facilement en nouvelles souches.
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